PKHD1-样1; PKHD1L1
纤维囊蛋白-L
HGNC 批准的基因符号:PKHD1L1
细胞遗传学位置:8q23.1-q23.2 基因组坐标(GRCh38):8:109,362,461-109,537,207(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
霍根等人(2003) 在人类基因组中搜索了与 D86 类似的蛋白质序列,D86 是一种与纤维囊肿素 N 端半部同源的小鼠蛋白质(PKHD1; 606702)。他们鉴定出 BAC 克隆 PKHD1L1,位于人类染色体 8q23 上。通过 RT-PCR 将 13,801 bp 的转录物扩增为 16 个片段并进行测序。 PKHD1L1 覆盖 168 kb 的基因组区域并编码一个大蛋白(纤维囊蛋白-L)。 Fibrocystin-L 被预测为一种大受体蛋白(4,243 个氨基酸;466 kD),具有信号肽、单跨膜结构域和短胞质尾。 Fibrocystin-L 在大部分细胞外区域与纤维囊肿蛋白同源,总体同一性为 25.0%,相似性为 41.5%。 Fibrocystin-L 具有与纤维囊蛋白相似的胞外结构域,具有 14 个 TIG 结构域拷贝和 2 个与蛋白质 TMEM2(605835) 显着同源的区域。河豚鱼具有纤维囊肿素-L 直系同源物,但没有纤维囊肿素,这表明新发现的蛋白质可能是其祖先形式。
▼ 基因结构
霍根等人(2003) 确定 PKHD1L1 包含 78 个外显子并跨越 168 kb 的基因组区域。
▼ 基因功能
霍根等人(2003) 确定 PKHD1L1 及其鼠类直系同源物 Pkhd1l1 在大多数组织中以低水平广泛表达,但仅在血液来源的细胞系中检测到。在许多初级免疫细胞亚型中检测到低水平表达,但在激活信号后,T 淋巴细胞中特异上调,表明在细胞免疫中发挥作用。
▼ 测绘
Hogan 等人使用基因组测序(2003) 将 PKHD1L1 基因定位到染色体 8q23。
▼ 分子遗传学
Hogan 等人在没有 PKHD1 突变的常染色体隐性多囊肾病(ARPKD; 263200) 患者中筛查 PKHD1L1(2003) 发现了几个序列变异,但没有明显的突变,因此不太可能与 ARPKD 相关。