条纹蛋白,钙调蛋白结合蛋白; STRN

HGNC 批准的基因符号:STRN

细胞遗传学位置:2p22.2 基因组坐标(GRCh38):2:36,837,698-36,966,536(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

卡斯特等人(1996) 从大脑 cDNA 文库中克隆了大鼠 Strn。推导的 780 个氨基酸的蛋白质在 N 端半部有 2 个高电荷结构域,在 C 端半部有 8 个 WD 重复序列。 Northern印迹分析检测到多种Strn转录本在大鼠脑、小脑和脊髓中表达不同,在睾丸中表达较弱。 Strn也在小鼠大脑中表达。大鼠大脑的原位和免疫组织化学分析检测到感觉运动皮层 V 层以及小脑、海马和嗅球中最强的 Strn 表达。 Strn 特别集中在树突棘中,而排除在轴突之外。

Moqrich 等人使用大鼠 Strn 序列作为查询(1998) 在人扁桃体和心脏 EST 文库中鉴定了假定的 STRN 序列,并通过 RT-PCR,他们从 NT2 畸胎癌 cDNA 文库中克隆了 STRN。推导的 780 个氨基酸蛋白具有 8 个 C 端 WD 重复序列,与小鼠和大鼠的直向同源物具有超过 90% 的序列同一性。 Northern blot分析检测到8.1和6.1 kb的转录本,在人脑中高表达,在胎盘和肾脏中表达较低,在其他组织中表达极低。 8.1-kb 转录本在大脑中更丰富,并且相对于 6.1-kb 转录本似乎是 3-prime UTR 剪接变体。数据库分析揭示了整个动物界的 STRN 直系同源物,包括果蝇和线虫。

卡斯特等人(2000) 发现 striatin 蛋白具有与齐尼丁(STRN4; 614767) 和 SG2NA(STRN3; 614766) 相同的结构,包括一个假定的 N 末端小窝蛋白(参见 CAV1, 601047)结合域,随后是一个卷曲的-螺旋区域,一个推定的钙调蛋白(参见 114180)结合域,和 8 个 WD 重复分布在 C 端一半。对大鼠脑切片的免疫组织化学分析显示,striatin 和 Sg2na 在树突中表达,但在轴突中不表达,并且通常存在于不同类型的神经元中。在大鼠脑匀浆中,大约一半的纹状体蛋白、Sg2na 和齐嗪蛋白是膜结合的并由去污剂释放。

通过检查小鼠纹状蛋白的 N 末端序列,莫雷诺等人(2000) 发现蛋白磷酸酶 2A(PP2A) 复合物(参见 PP2CA, 176915)的调节 B-pr​​ime 亚基(参见 PPP2R4, 600756)之间存在保守区域。

▼ 基因家族

通过系统发育分析,Castets 等人(2000) 确定 striatin、zinedin 和 SG2NA 源自共同的祖先基因,并编码相似的多模块蛋白。

▼ 基因功能

莫雷诺等人(2000) 使用针对 PP2A 调节性 B 启动子亚基的相对非特异性抗体来免疫沉淀来自 NIH3T3 小鼠成纤维细胞的相关蛋白。对二维凝胶分离的蛋白质进行质谱分析显示,除了催化亚基(参见 PPP2CA,176915)和结构亚基(参见 PPP2R1A,605983)外,还存在表观分子量分别为 110 kD 和 93 kD 的 striatin 和 Sg2na,以及一些未知的蛋白质。在交互实验中,针对 striatin 和 Sg2na 的抗体免疫沉淀催化和结构 PP2A 亚基。在免疫沉淀物中未检测到 B 型调节亚基,例如 B56(PPP2R5D;601646)。 Striatin 和 Sg2na 复合物表现出磷酸酶活性,该活性在很大程度上被冈田酸抑制并且与钙无关。 PP2A催化亚基C末端的缺失并不影响PP2A复合物中striatin或Sg2na的结合,表明它们可能是非典型的B型调节亚基。 striatin 和 Sg2na 也以钙依赖性方式结合固定化钙调蛋白。

卡斯特等人(2000) 发现细胞质大鼠脑纹素、齐尼丁和 Sg2na 的所有 3 种同工型在钙存在的情况下与固定化钙调蛋白结合,并用 EDTA 洗脱。

▼ 基因结构

卡斯特等人(2000)确定STRN基因包含18个编码外显子。

▼ 测绘

使用 FISH,Moqrich 等人(1998) 将 STRN 基因定位到染色体 2p22-p21。

▼ 动物模型

致心律失常性右室心肌病(ARVC、ARVD;参见 107970)是一种以室性心律失常和猝死为特征的家族性心脏病。巴索等人(2004) 描述了拳师犬自发性 ARVC 模型。 Meurs 等人利用全基因组关联研究,然后进行精细作图、PCR 和测序(2010) 发现拳师犬的家族性 ARVC 是由于 17 号染色体上的犬 striatin 基因 3-prime UTR 中的 8-bp 杂合缺失所致。预计该缺失会改变茎环结构,并与减少受影响的狗的心脏纹素 mRNA 和蛋白质。在正常对照心脏组织中,条纹蛋白定位于闰盘并与桥粒蛋白共定位。

▼ 历史

在小鼠中,Wadhwa 等人(1999) 鉴定了 striamin,它被称为 Strn2,但与人类 striatin 不同。