PTPRF 相互作用蛋白 α-3; PPFIA3
受体型蛋白质酪氨酸磷酸酶 F 多肽相互作用蛋白 α 3
LIPRIN-α-3
HGNC 批准的基因符号:PPFIA3
细胞遗传学位置:19q13.33 基因组坐标(GRCh38):19:49,119,544-49,151,026(来自 NCBI)
▼ 说明
PPFIA3 或 liprin-α-3,属于 liprin-α 基因家族(Serra-Pages 等,1998)。有关 liprin 的背景,请参阅 liprin-α-1(LIP1 或 PPFIA1;611054)。
▼ 克隆与表达
塞拉-佩吉斯等人(1998) 鉴定了一个编码 LIP1 相关蛋白或脂蛋白的基因家族。预测的部分474个氨基酸的liprin-α-3多肽的序列与LIP1的序列有72%相同。塞拉-佩吉斯等人(1998) 提出,liprins 是多价蛋白质,形成复杂的结构,充当 LAR 家族 PTPase 的招募和锚定的支架。 Northern 印迹分析表明,liprin-α-3 基因仅在大脑中以 5 kb mRNA 的形式表达。
Ishikawa 等人通过筛选人脑 cDNA 中编码大于 50 kD 的蛋白质(1998) 鉴定了 KIAA0654,一种 liprin-α-3 cDNA。由于第一个 ATG 不在 Kozak 共有区域内,因此 KIAA0654 cDNA 可能缺少一些 5 引物序列。预测的 1,093 个氨基酸的多肽与 LIP1 具有 52% 的序列同一性。 SDS-PAGE显示该cDNA的体外转录/翻译产物的分子量大于100kD。 RT-PCR 显示 liprin-α-3 在多种组织中表达。
▼ 测绘
通过对辐射混合面板的分析,Ishikawa 等人(1998) 将 liprin-α-3 基因定位到 19 号染色体。
Gross(2022) 根据 PPFIA3 序列(GenBank BC101518) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PPFIA3 基因对应到染色体 19p13.3。