丝氨酸棕榈酰转移酶,小亚基,B; SPTSSB
丝氨酸棕榈酰转移酶 B 小亚基; SSSPTB
ADMP,小鼠,同系物; ADMP
染色体 3 开放解读码组57; C3ORF57
HGNC 批准的基因符号:SPTSSB
细胞遗传学位置:3q26.1 基因组坐标(GRCh38):3:161,344,798-161,371,517(来自 NCBI)
▼ 说明
丝氨酸棕榈酰转移酶(SPT;EC 2.3.1.50)催化鞘脂生物合成中的第一个关键限速步骤。 SSSPTB 是一个小的 SPT 亚基,可刺激 SPT 活性并赋予酰基辅酶 A 优先于 SPTLC1(605712) 和 SPTLC2(605713) 或 SPTLC3(611120) 的 SPT 催化异二聚体的作用(Han et al., 2009)。
▼ 克隆与表达
Singh 等人使用抑制性消减杂交(2005) 从性腺功能减退(hpg) 小鼠前列腺中克隆了一种新的雄激素抑制基因,他们将其称为 Admp(在小鼠前列腺中表达的雄激素下调基因)。通过以小鼠序列作为查询的数据库搜索,Singh 等人(2005) 鉴定了人类同源物 C3ORF57,它编码推导的 76 个氨基酸蛋白质,与小鼠 Admp 具有 85.5% 的序列同一性。使用 DIG 标记的 C3ORF57 反义探针进行原位杂交,显示人类前列腺上皮细胞中存在信号。在雄激素存在的情况下,前列腺癌细胞系 LNCaP 中的 C3ORF57 表达下调。
使用人类 cDNA 表达文库来补充酵母小 SPT 亚基 Tsc3 缺陷的酵母菌株,Han 等人(2009) 确定了 SSSPTA(613540) 和 SSSPTB。推导的 76 个氨基酸 SSSPTB 肽包含 2 个预测的跨膜跨度,与 SSSPTA 具有 45% 的同一性,其中最相似的是与跨膜跨度 2 重叠的中心 28 个氨基酸结构域。SSSPTA 和 SSSPTB 均不与酵母 Tsc3 具有序列相似性。数据库分析揭示了人类 SSSPT 在几种脊椎动物中的密切直系同源物。
▼ 基因功能
韩等人(2009) 表明表达人 SPTLC1-SPTLC2 或 SPTLC1-SPTLC3 异二聚体的酵母表现出最小的 SPT 活性。然而,SSSPTB 或 SSSPTA 的共表达显着增加了 SSPT 活性,其中 SSSPTA 是比 SSSPTB 更强的激活剂。分裂泛素 2 杂交分析表明,SSSPTB 直接与 SPTLC1 相互作用,即使在 SPTLC2 不存在的情况下也是如此。使用一组酰基辅酶A底物和不同的SPT亚基组合表明不同的SPT同工酶具有特定的底物偏好。最活跃和选择性最强的同工酶组合是 SPTLC1-SPTLC2-SSSPTA,它对 C16-CoA 有很强的偏好。用 SPTLC3 替换 SPTLC2 产生对 C16-CoA 和 C14-CoA 具有同等偏好的同工酶,用 SSSPTB 替换 SSSPTA 产生对较长酰基辅酶 A 具有同等偏好的同工酶。
▼ 基因结构
辛格等人(2005) 确定 C3ORF57 基因包含 3 个外显子,跨度为 70 至 90 kb。 ORF 完全包含在外显子 3 内。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Singh 等人(2005) 将 C3ORF57 基因定位到染色体 3q26.1。他们通过辐射杂交分析证实了 3q25.2-q26.2 的定位。