PR 结构域蛋白 10; PRDM10
TRISTANIN; TRIS
KIAA1231
HGNC 批准的基因符号:PRDM10
细胞遗传学位置:11q24.3 基因组坐标(GRCh38):11:129,899,711-130,002,835(来自 NCBI)
▼ 说明
PRDM10 属于锌指转录因子小家族,称为正调控域成员(PRDM)。其他 PRDM 包括 BLIMP1(PRDM1;603423)和 RIZ(PRDM2;601196)(Siegel 等,2002)。
▼ 克隆与表达
长濑等人(1999) 从胎儿脑 cDNA 文库中获得了 PRDM10 的部分 cDNA,他们将其称为 KIAA1231。推导的氨基酸序列与人 ZNF45(194554) 具有同源性。人体组织的 RT-PCR ELISA 检测到胎儿肝脏和成人脑、肾、卵巢和脊髓中有中等程度的 PRDM10 表达。在检查的所有其他成人和胎儿组织中表达较低或检测不到。 PRDM10 在所检查的所有特定大脑区域中均显示出中等表达。
使用基于 cat Prdm10 的探针,Siegel 等人通过 PCR 筛选胎儿大脑 cDNA 文库(2002) 克隆了全长人类 PRDM10,他们将其称为 Tristanin。推导的 1,023 个氨基酸的人类蛋白包含一个 N 末端正调节结构域(PRD),随后是 10 个 Kruppel 型(CCHH) 锌指基序。数据库分析表明存在多个 PRDM10 剪接变体。对小鼠和猫脑的 Northern 和 Western 印迹分析显示,多种 Prdm10 剪接变体和蛋白质亚型似乎受到发育调节,与成人相比,新生儿中的一些变体和亚型上调。除大脑外,还在小鼠肝脏、肾脏、脾脏和胸腺中检测到 Prdm10 蛋白亚型。免疫组织化学分析表明,Prdm10 在新生小猫和小鼠的整个神经元细胞体中呈点状表达,但这种表达在成年后消失。
▼ 基因功能
西格尔等人(2002) 发现 Prdm10 的一个小变体在 GM2 神经节苷脂沉积症猫模型中表达上调(参见 272800)。免疫组织化学分析还显示,Prdm10 保留在患病猫(而非健康 3 个月大的猫)的皮质神经元细胞核中。作者基于 PRDM10 在大脑发育和神经节苷脂沉积症模型中的上调,推测其可能参与树突发生。
▼ 测绘
Nagase 等人使用辐射杂交分析(1999) 将 PRDM10 基因定位到 11 号染色体。
Gross(2019) 根据 PRDM10 序列(GenBank BC112934) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PRDM10 基因对应到染色体 11q24.3。