谷氨酰胺:果糖-6-磷酸酰胺转移酶 2; GFPT2
GFAT2
HGNC 批准的基因符号:GFPT2
细胞遗传学位置:5q35.3 基因组坐标(GRCh38):5:180,300,698-180,353,336(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
谷氨酰胺:果糖-6-磷酸酰胺转移酶(GFAT) 是己糖胺生物合成途径的第一个也是限速酶。该酶将酰胺基从 L-谷氨酰胺转移到果糖 6-磷酸,形成葡萄糖胺 6-磷酸。参见 GFAT1(GFPT1;138292)。 Oki 等人通过在 EST 数据库中搜索与 GFAT1 相关的序列(1999) 鉴定了一种编码新 GFAT 亚型的 cDNA,他们将其称为 GFAT2。作者还克隆了小鼠 GFAT2 cDNA。预测的 682 个氨基酸的人类蛋白质分别与人类 GFAT1 和小鼠 Gfat2 具有 76% 和 97% 的相似性。重组GFAT2在体外表现出GFAT酶活性。 Northern 印迹分析显示,GFAT2 主要以 3 kb mRNA 的形式表达,尽管某些组织中还存在其他转录本。在心脏、胎盘和脊髓中观察到最高水平的表达。
▼ 基因结构
张等人(2004)指出GFAT2基因包含19个外显子。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Oki 等人(1999) 将 GFAT2 基因对应到 5q34-q35。这些作者使用种间回交将小鼠 Gfat2 基因定位到 11 号染色体,该区域与人类 5q23-q35 具有同线性同源性。
▼ 分子遗传学
张等人(2004) 测试了以下假设:GFPT2 序列变异导致白种人和非洲裔美国人对 II 型糖尿病(NIDDM; 125853) 和糖尿病肾病(见 603933) 的易感性。他们鉴定了 11 个 SNP,其中 7 个是常见的。外显子 14 中的单个变异改变了氨基酸序列,在人类和小鼠基因之间是保守的,并且与白种人中的 NIDDM 相关(p = 0.05)。 3 素非翻译区(UTR) 和外显子 18 中的多个变异也与白种人个体中的 NIDDM 相关(P 小于 0.05),并且 3 素 UTR 中的 SNP 与非裔美国人受试者中的糖尿病肾病相关(p = 0.047)。无论诊断如何,与白种人相比,非裔美国人受试者的转化淋巴细胞中 GFPT2 mRNA 水平显着增加。作者提出,3-prime UTR 变体导致 GFPT2 mRNA 水平增加,从而导致己糖胺通量增加。他们认为错义变体可能导致蛋白质功能改变,或者可能只是与 3-prime UTR 中的 SNP 连锁不平衡。