成纤维细胞生长因子,酸性,细胞内结合蛋白; FIBP
HGNC 批准的基因符号:FIBP
细胞遗传学位置:11q13.1 基因组坐标(GRCh38):11:65,883,740-65,888,471(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Kolpakova 等人使用酵母 2-杂交系统(1998) 鉴定了一种 HeLa 细胞 cDNA,作者将其称为 FIBP,它与酸性成纤维细胞生长因子(FGF1;131220) 相互作用。 FIBP cDNA 编码推导的 372 个氨基酸的蛋白质,预测分子量为 42 kD。该蛋白主要是亲水性的并且没有N端信号序列。 Northern blot 分析表明 FIBP 和 FGF1 具有相似的表达模式。 FIBP 以大约 1.4 kb 的转录本形式普遍表达,在心脏、骨骼肌和胰腺中表达水平最高,在大脑中表达水平稍低。体外实验表明,FIBP 很容易附着在微粒体膜上,并且能够以高亲和力结合 FGF1。免疫荧光研究表明,FIBP 主要定位于细胞核,少量定位于线粒体和其他细胞质膜。蛋白质印迹分析表明存在 2 种形式的 FIBP。
通过 RT-PCR 分析,Kolpakova 等人(2000) 鉴定了由外显子 5 的选择性剪接引起的第二个 FIBP 转录物,并产生具有额外 7 个残基的蛋白质。他们克隆并表征了小鼠 Fibp 基因,并通过数据库搜索鉴定了果蝇同源基因。人类 FIBP 与小鼠和果蝇同源物分别具有 97% 和 46% 的序列同一性。
阿卡维等人(2016) 发现 Fibp 基因在小鼠胚胎中表达。在 E10.5 天,在整个胚胎中观察到均匀的微弱信号。在E12.5天,它在中枢神经系统的所有区域中表达,其中在背侧中脑和前脑、尾侧间脑的腹侧部分以及背根神经节中高表达。在肾脏和肺中也检测到表达,但在心脏中未检测到表达。
▼ 基因结构
科尔帕科娃等人(2000) 确定 FIBP 基因包含 10 个外显子,跨度超过 5 kb。对翻译起始点周围区域的序列分析揭示了一个 CpG 岛。启动子区域的功能研究表明具有很强的转录活性。
▼ 测绘
通过 FISH,Kolpakova 等人(2000) 将 FIBP 基因定位到染色体 11q13.1。
▼ 分子遗传学
一名 23 岁男性,其父母为北非近亲,患有 Thauvin-Robinet-Faivre 综合征(TROFAS; 617107),Thauvin-Robinet 等人(2016) 鉴定了 FIBP 基因中的纯合无义突变(Q218X; 608296.0001)。通过外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分离。与对照组相比,患者成纤维细胞显示出过度增殖。
3 个兄弟姐妹,由近亲阿拉伯父母所生,有 TROFAS、Akawi 等人(2016) 鉴定了 FIBP 基因中的纯合突变(608296.0002)。与对照组相比,患者成纤维细胞显示出细胞增殖增加。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 THAUVIN-ROBINET-FAIVRE 综合症
FIBP、GLN218TER
一名 23 岁男性,其父母为北非近亲,患有 Thauvin-Robinet-Faivre 综合征(TROFAS; 617107),Thauvin-Robinet 等人(2016) 在 FIBP 基因中发现了一个纯合的 c.652C-T 转换(chr11.65,652,652G-A, GRCh37),导致 gln218 到 ter(Q218X) 的替换。该突变是通过外显子组测序发现并通过桑格测序确认的,并根据 dbSNP(版本 135)和外显子组测序项目数据库以及 260 个内部外显子组进行筛选。该突变与家庭中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞的 FIBP 转录物水平显着降低,表明无义介导的 mRNA 衰减。与对照组相比,患者成纤维细胞显示出过度增殖。
.0002 THAUVIN-ROBINET-FAIVRE 综合征
FIBP、3-BP INS、175TAA
Akawi 等人在 3 名同胞中,由近亲阿拉伯父母所生,患有 Thauvin-Robinet-Faivre 综合征(TROFAS; 617107)(2016) 在 FIBP 基因中鉴定出纯合框内 3-bp 插入(c.175_176insTAA, NM_198897.1),导致插入缺失(His59delinsLeuAsn)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序得到证实。该突变与家族中的疾病分离,并且在公共数据库或内部对照外显子组中未发现。与对照组相比,患者成纤维细胞显示出细胞增殖增加。