无菌 α 基序结构域蛋白 11； SAMD11

主要视网膜 SAM 结构域蛋白；MR-S

HGNC 批准的基因符号：SAMD11

细胞遗传学位置：1p36.33 基因组坐标（GRCh38）：1:923,923-944,574（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

井上等人（2006） 从视网膜 cDNA 文库中克隆了小鼠 Samd11，他们将其称为 mr-s。推导的 542 个氨基酸的蛋白质在 N 末端附近有一个核定位信号，在 C 末端附近有一个 SAM 结构域。数据库分析揭示了推导的 544 个氨基酸的人类直系同源物，其与小鼠 Samd11 具有 70% 的整体同一性以及 SAM 结构域的 90% 同一性。 Northern 印迹分析在出生后第 7 天（P） 小鼠视网膜中检测到 4 个不同大小的 Samd11 转录本，而在检查的其他 8 个小鼠组织中几乎没有表达。 RT-PCR检测新生儿和成人松果体中Samd11的表达。小鼠胚胎的原位杂交在胚胎第 18 天时在神经母细胞层（假定的光感受器层）中检测到微弱信号。在 P3 发育中的光感受器层中检测到 Samd11 的较高表达，并在 P6 时光感受器层中表达达到峰值，a与光感受器终末分化相一致的时间。共聚焦显微镜显示表位标记的 Samd11 主要位于转染的 HEK293T 细胞的细胞核中。

金等人（2013） 鉴定了人类 SAMD11 基因的 45 个可变剪接变体。 RT-PCR 检测到许多细胞系和眼组织中转录物的复杂分布。最丰富的变体是保留内含子 6b 并跳过外显子 7c 的变体。 Western bot 分析表明，SAMD11 的蛋白水平并不总是与 mRNA 水平相对应；例如，眼组织中的水平存在差异。在小鼠 Samd11 基因中检测到类似但不相同的剪接变体。

▼ 基因结构

金等人（2013）确定SAMD11基因包含14个外显子。

▼ 测绘

井上等人（2006） 报道人类和小鼠 SAMD11 基因分别对应到染色体 1p36.33 和 4E2。

▼ 基因功能

井上等人（2006） 发现，在缺乏同源框 Crx（602225） 表达的出生后第 5 天的小鼠视网膜中，Samd11 的表达显着降低，表明 Crx 是 Samd11 表达所必需的。酵母 2 杂交和免疫共沉淀分析表明，Samd11 通过其 SAM 结构域进行自关联，并通过其 N 端序列进行更弱的自关联。当与 DNA 结合结构域融合时，Samd11 抑制 HEK293T 细胞和 Y79 视网膜母细胞瘤细胞中报告基因的表达。转录抑制需要 Samd11 的 C 端结构域，但不需要其 SAM 结构域。

金等人（2013） 发现，当 CRX、OTX2（600037） 或 NR2E3（604485） 表达载体单独或组合引入 RPE 和 293T 细胞时，不同长度的 SAMD11 近端启动子的荧光素酶活性没有改变。