WD 重复平面单元极性效应器; WDCP
染色体 2 开放解读码组 86; C2ORF86
FRITZ,果蝇,同源物
BBS15 基因;BBS15
HGNC 批准的基因符号:WDPCP
细胞遗传学位置:2p15 基因组坐标(GRCh38):2:63,119,559-63,840,826(来自 NCBI)
▼ 说明
WDPCP 基因编码果蝇“fritz”的直系同源基因。控制平面细胞极性的细胞质 WD40 重复蛋白(Kim et al., 2010)。 WDPCP 定位于纤毛基部和肌动蛋白细胞骨架,是纤毛发生和定向细胞迁移所必需的(Cui et al., 2013)。
▼ 克隆与表达
在果蝇中,科利尔等人(2005)描述了“弗里茨”;(frtz),编码进化上保守的卷曲螺旋 WD40 蛋白,该蛋白在核心平面细胞极性(PCP) 蛋白(例如“卷曲”603408 和“蓬乱”)下游细胞自主地发挥作用; 601365) 调节翼细胞前毛起始位点的位置和数量。
科利尔等人(2005) 发现人类 Fritz 基因编码一种由 713 个氨基酸组成的蛋白质,具有卷曲螺旋结构域、2 个 WD40 重复序列和富含脯氨酸的结构域。弗里茨富含脯氨酸的区域是物种中差异最大的。在果蝇中,它含有 14.5% 的脯氨酸,预计会折叠成随机卷曲。在哺乳动物 Fritz 蛋白中,等效区域较短,且脯氨酸含量不明显,并且在小鼠和人类之间存在显着差异,仅显示 45% 的同一性,而其余蛋白质的同一性为 82%。果蝇、小鼠和人类 Fritz 蛋白在其 C 末端共享一个高度保守的疏水性 10 个氨基酸肽。哺乳动物 Fritz 的 2 个 WD40 重复折叠在一起形成 β 螺旋桨结构,为蛋白质-蛋白质相互作用提供表面。
使用免疫组织化学分析,Cui 等人(2013) 发现小鼠 Wdpcp 是一种纤毛蛋白,与 Sept2(601506) 共定位于 IMCD3 小鼠内髓集合管细胞和转染的 NIH3T3 成纤维细胞中纤毛基部的环状结构中。 Wdpcp 还与 Sept2 共定位于小鼠胚胎成纤维细胞(MEF) 的肌动蛋白丝中。
▼ 测绘
Hartz(2010) 根据 WDPCP 序列(GenBank AF131737) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 WDPCP 基因对应到染色体 2p15。
崔等人(2013) 指出小鼠 Wdpcp 基因定位于 11 号染色体。
▼ 基因功能
金等人(2010) 确定 PCP 蛋白 Fritz 对 septin(参见 SEPT7, 603151)定位的控制是爪蟾胚胎中集体细胞运动和纤毛发生的关键控制点。作者证明了 Fritz 和 septins 控制会聚延伸和胚孔闭合。 Fritz morphants在颅面形态发生和hedgehog(见600725)信号方面表现出缺陷,类似于与纤毛发生缺陷相关的缺陷。
Toriyama 等人在小鼠肾 IMCD3 细胞中使用串联亲和纯化和质谱分析,然后进行下拉和免疫共沉淀分析(2016) 识别并描述了一个调节模块,他们将其称为 CPLANE(纤毛发生和平面极性效应器)。核心 CPLANE 复合体由 Intu(610621)、Fuz(610622) 和 Wdpcp 组成,这些蛋白也与 Cplane1(614571) 和 Rsg1(CPLANE2) 强烈相互作用。作者指出,在人类蛋白质的高通量筛选中观察到类似的相互作用,并且在果蝇中是保守的。 Intu、Fuz、Wdpcp、Rsg1 和 Cplane1 位于非洲爪蟾多纤毛细胞(MCC) 的基体周围。敲低实验显示蛋白质之间功能相互作用的复杂层次结构,其中 Cplane1 是所有 CPLANE 蛋白基体定位所必需的,但 Fuz 位于层次结构的顶部。蛋白质组数据表明,CPLANE 蛋白与核心和外周鞭毛内转运 A(IFT-A) 复合体亚基特异性相互作用,但不与 IFT-B 亚基相互作用。在爪蟾 MCC 中,Cplane1 需要将外周 IFT-A 亚基募集到基体,以便组装到 IFT-A 核心上。 Cplane1或Wdpcp敲低后,缺乏外周蛋白的IFT-A核心颗粒被注入轴丝并进行正常的双向转移,而IFT-B颗粒进入轴丝但未能逆行移动并积累。鸟山等人(2016) 得出结论,CPLANE 蛋白指导 IFT 机制的基底体募集,并且对于纤毛发生至关重要。
▼ 分子遗传学
巴代-比德尔综合征
由于弗里茨在非洲爪蟾的会聚延伸和纤毛发生中的作用,Kim 等人(2010) 研究了人类 Fritz 对 Meckel-Gruber 综合征(参见 249000) 和 Bardet-Biedl 综合征(209900) 疾病的影响。金等人(2010) 发现与对照组相比,Meckel-Gruber 综合征和 Bardet-Biedl 综合征患者的人 Fritz(C2ORF86) 的非同义编码变化显着丰富(192 名患者中有 6 个等位基因,而 384 名患者中有 0 个等位基因;p 小于 0.015)。在梅克尔-格鲁伯综合征队列中,Kim 等人(2010) 没有鉴定出足以解释表型的等位基因,这表明这些变化可能与主要的梅克尔-格鲁伯综合征基因座相互作用。在 Bardet-Biedl 综合征队列中,Kim 等人(2010) 发现 384 个种族匹配的对照、HapMap 和 1,000 个基因组中不存在 2 个杂合错义等位基因。此外,其中 2 个变化对应到弗里茨蛋白预测的 β 螺旋桨结构的相同表面暴露面。值得注意的是,金等人(2010) 发现纯合 Fritz 突变与 Bardet-Biedl 综合征家族中的疾病分离(613580.0001)。
先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多指并指
萨里等人(2015) 报道了一名患有先天性心脏缺陷、舌头错构瘤和多指畸形(CHDTHP; 217085) 的女孩,她是错义(D54N; 613580.0004) 和移码突变(613580.0005) 的复合杂合子。
Toriyama 等人对一名患有 CHDTHP 的卢森堡 5 岁男孩进行了研究(2016) 鉴定了先前报道的 D54N 突变和 WDPCP 基因中的移码突变(613580.0006) 的复合杂合性。
▼ 动物模型
使用乙基亚硝基脲诱变筛选,Cui 等人(2013) 鉴定出具有 Wdpcp 突变的小鼠,他们将其称为 Wdpcp(cys40)。 Wdpcp(cys40)突变是224A-G转变,导致Wdpcp转录本中的剪接缺陷和Wdpcp蛋白的过早终止。在突变小鼠中未检测到 Wdpcp(cys40) 蛋白。 Wdpcp(cys40)小鼠具有与Mks1(609883)突变小鼠相似的表型,包括无眼症、肾脏和其他器官囊肿、复杂的先天性心脏缺陷(包括动脉干或肺动脉闭锁)以及房室间隔缺损。一些 Wdpcp(cys40) 小鼠患有双肾、面裂和/或腭裂、气管食管瘘和泄殖腔分隔缺陷。 Wdpcp -/- 小鼠在出生时死亡,具有与 Wdpcp(cys40) 小鼠相同的发育异常谱。在 Wdpcp -/- 或 Wdpcp(cys40) 小鼠中未观察到偏侧性缺陷。对 Wdpcp(cys40) 突变体胚胎和 MEF 的检查显示初级纤毛的纤毛发生有缺陷,但运动纤毛则不然。大多数 Wdpcp(cys40) MEF 缺乏初级纤毛,而那些具有纤毛的稀有细胞在纤毛过渡区显示 Sept2、Mks1 和 Nphp1(607100) 缺失或错误定位。突变胚胎和细胞表现出 Shh(600725) 信号传导破坏和 PCP 缺陷,包括非规范 Wnt 表达减少(参见 606359)和规范 Wnt 信号传导上调。培养中的 Wdpcp(cys40) 细胞还表现出不存在 Sept2 阳性应力纤维、膜波纹减少、焦点接触异常强以及缺乏极化运动。 Wdpcp 的功能在低等脊椎动物中似乎并不保守,因为在斑马鱼中吗啉代介导的 wdpcp 敲低引起了一系列表明运动纤毛缺陷的表型,但没有破坏纤毛发生。
鸟山等人(2016) 生成了 Wdpcp-null 小鼠,并在胚胎第 14.5 天观察到具有 Y 形掌骨的多指畸形。此外,突变型腭凝结比野生型胚胎更靠近内侧形成,并且未能延伸到口腔中。
▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):
.0001 BARDET-BIEDL 综合征 15(1 名患者)
WDPCP、NT76、G-T、-1
Kim 等人在 Bardet-Biedl 综合征 15(BBS15; 615992) 患者的 cDNA 中(2010) 鉴定了 WDPCP 基因剪接位点 -1 位置处 G 到 T 转变的纯合性。父母和未受影响的同胞都是杂合子携带者。这种突变发生在 Fritz 的一个不变位置上,但在 384 条对照染色体、HapMap 或 1,000 个基因组中并未发现。
.0002 BARDET-BIEDL 综合征 12,修饰符
WDPCP、LEU208PHE
Kim 等人在患有 Bardet-Biedl 综合征 12(BBS12; 615989) 的患者中(2010) 鉴定了 WDPCP 基因中 624G-C 颠换的杂合性,导致密码子 208(L208F) 处亮氨酸替换为苯丙氨酸。该患者也是 BBS12 基因突变的复合杂合子(610683)。
.0003 梅克尔综合征,6 型,修饰符
WDPCP、ARG55LYS
Kim 等人在一名患有 Meckel-Gruber 综合征 6(MKS6; 612284) 的患者中(2010) 鉴定了 WDPCP 基因(R55K) 密码子 55 处精氨酸到亮氨酸取代的杂合性。该突变源自 164G-A 转变。该患者也是 CC2D2A 基因突变的复合杂合子(612013)。
.0004 先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多趾畸形
WDPCP、ASP54ASN
萨里等人(2015) 报道了一名患有先天性心脏缺陷、舌头错构瘤和多指畸形(CHDTHP; 217085) 的 3 岁女孩,她是 WDPCP 基因突变的复合杂合子。一种是 c.160G-A 转换,导致 asp54 到 asn(D54N) 替换。患者的母亲是这种突变的杂合子,而未受影响的同胞均不携带这种突变。 D54N 取代在整个进化过程中高度保守,从斑马鱼到水蚤;该变体与 Kim 等人报道的 R55K(613580.0003) 非同义编码变体直接相邻(2010) 一位患有梅克尔综合征 6 的患者(MKS6; 612284)。由于电荷变化,多种算法预测 D54N 错义突变是有害的,并且还可能破坏剪接位点。在千人基因组计划数据库中未发现该基因,在外显子组测序计划数据库中仅发现一次,出现频率为每 11,827 人中就有 1 人。 WDPCP 中的另一个突变是 2 bp 缺失,c.552_553del,导致 cys185(C185fs) 后发生移码替换。这种突变存在于患者无症状的父亲、兄弟和姐妹身上。
Toriyama 等人对一名患有 CHDTHP 的 5 岁卢森堡男孩(病例 1)进行了研究(2016) 鉴定了 WDPCP 基因中 D54N 突变和 2 bp 缺失(526_527delTT; 613580.0006) 的复合杂合性。后一种突变预计会导致移码,从而导致提前终止密码子(Leu176Ilefs*21)。他未受影响的父母均具有其中一种突变的杂合子。 D54N 突变被称为 D54A,移码突变的影响被称为 Leu176PhefsTer23,如图 6 所示。
.0005 先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多趾畸形
WDPCP、2-BP DEL、NT552
Saari 等人讨论了 WDPCP 基因中的 c.552_553del 突变,该突变在患有先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多指畸形(CHDTHP; 217085) 的患者中以复合杂合状态发现(2015),参见 613580.0004。
.0006 先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多趾畸形
WDPCP、2-BP DEL、NT526
Toriyama 等人讨论了 WDPCP 基因中的 c.526_527delTT 突变,该突变在患有先天性心脏缺陷、舌错构瘤和多指并指(CHDTHP; 217085) 的患者中以复合杂合状态发现(2016),参见 613580.0004。