tRNA 甲基转移酶亚基 11-2; TRMT112
TRM112
tRNA 甲基转移酶 11-2,酿酒酵母,同源物
HGNC 批准的基因符号:TRMT112
细胞遗传学位置:11q13.1 基因组坐标(GRCh38):11:64,316,460-64,318,596(来自 NCBI)
▼ 说明
TRM112 是一种进化上保守的甲基转移酶相互作用蛋白(van Tran et al., 2018)。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 TRMT112 序列(GenBank BC017172) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TRMT112 基因对应到染色体 11q13.1。
▼ 基因功能
Sardana 和 Johnson(2012) 表明,酵母 Bud23(615733) 和 Trm112 在物理和功能上相互作用,并且它们的突变体在 40S 核糖体亚基生物发生的同一步骤中存在缺陷。 Trm112 对于 40S 和 60S 生物发生都是必需的,但它主要以不依赖于 Bud23 的方式与 60S 一起沉积。 Trm112 与 60S 相关甲基转移酶 Nop2(164031) 和 Rcm1(NSUN5; 615732) 特异性相互作用。与 Trm112 的相互作用影响了部分(但不是全部)合作伙伴的稳定性。
范特兰等人(2018) 对 Haloferax volcanii 中的 Trm112 蛋白网络进行了功能和结构表征,并鉴定了 8 种与 Trm112 直接相互作用的不同甲基转移酶。功能和结构分析表明这些甲基转移酶与其真核直系同源物具有相似的甲基转移酶功能。
范特兰等人(2019) 鉴定 METTL5(618628) 是负责 18S rRNA 上 A1832(m6A1832) N6 甲基化的人类甲基转移酶。 METTL5 直接与 TRMT112 相互作用,形成异二聚体,为 METTL5 提供代谢稳定性。
▼ 生化特征
范特兰等人(2019) 以 1.6 埃分辨率获得了人类 METTL5-TRMT112 复合物的晶体结构。 TRMT112 包含一个锌结合域(ZBD) 和一个中心域。 ZBD 由 α 螺旋和 4 链反向平行 β 折叠组成。人TRMT112的ZBD缺乏其他真核Trm112蛋白中保守的4个半胱氨酸,因此不结合锌。中心结构域由 3 个 α 螺旋组成。 METTL5 由采用 I 类 S-腺苷甲硫氨酸(SAM) 依赖性甲基转移酶折叠的单个结构域组成,该折叠由中心 7 链 β 折叠组成,一侧有 4 个 α 螺旋,另一侧有 2 个 α 螺旋。 METTL5-TRMT112界面由29个METTL5残基和28个TRMT112残基形成,其特征在于一个大的中央疏水核。疏水界面被参与形成 8 个氢键和 2 个盐桥的极性残基包围。 METTL5 上的大疏水表面在复合物形成后被 TRMT112 掩盖,为 METTL5 在溶液中提供稳定性。