α-1,6-甘露糖基糖蛋白 β-1,6-N-乙酰葡萄糖胺基转移酶,同工酶 B; MGAT5B
UDP-N-乙酰葡萄糖胺:α-1,6-D-甘露糖苷 β-1,6-N-乙酰葡萄糖胺转移酶
GNT-VB
GNT-IX
HGNC 批准的基因符号:MGAT5B
细胞遗传学位置:17q25.2 基因组坐标(GRCh38):17:76,868,404-76,950,393(来自 NCBI)
▼ 说明
MGAT5B 基因编码 β-1,6-N-乙酰葡糖胺基转移酶(EC 2.4.1.155),其在复杂细胞表面 N-聚糖的合成中发挥作用(Kaneko 等人,2003)。
▼ 克隆与表达
Inamori 等人通过在数据库中搜索与 GNT-VA(MGAT5; 601774) 相似的序列,然后搜索大脑 cDNA 文库的 5-prime RACE(2003) 克隆了 MGAT5B,他们将其称为 GNT-IX。推导的 792 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 89.5 kD,与 GNT-VA 具有 42% 的同一性。它包含一个 N 端胞质尾、一个跨膜结构域、一个茎区、一个 C 端催化结构域和 8 个潜在的 N-糖基化位点。 Northern 印迹分析仅在大脑中检测到 5 kb 转录本。 RNA 点印迹分析在所有受检查的特定成人大脑区域和胎儿大脑中检测到 GNT-IX。
Kaneko 等人通过在 EST 数据库中搜索与 GNT-VA 相似的序列,然后对脑和神经母细胞瘤 cDNA 文库进行 PCR,(2003) 克隆了 MGAT5B,他们将其称为 GNT-VB。推导的 782 个氨基酸的蛋白质与 GNT-VA 有 41% 的同一性。金子等人(2003) 还鉴定了一种带有 6-bp 插入的 GNT-VB 剪接变体,该插入引入了 2 个额外的氨基酸(LQ)。实时 PCR 显示 GNT-VB 在大脑和睾丸中高表达,而在其他检查组织中几乎没有表达。 PCR-RFLP 实验在神经母细胞瘤细胞系中检测到了这两种变体,但在正常大脑中仅检测到了缺乏 6 bp 插入片段的变体。
▼ 基因功能
稻盛和夫等人(2003) 表明人 GNT-IV 通过 β-1,6 连接将 N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc) 转移到甘露糖底物上,并且它可以修饰 α-1,6-连接和 α-1,3-连接的甘露糖核心支链 N-聚糖的臂。
Kaneko 等人使用瞬时转染的 COS-7 细胞(2003)表明GNT-VA和GNT-VB都将GlcNAc转移到合成糖和N-连接糖肽上。与 GNT-VA 不同,GNT-VB 需要 Mg(2+) 才能发挥全部活性。在用含有 6 bp 插入片段的 GNT-VB cDNA 转染的 COS-7 细胞中,测量到较低的转移酶活性。表达 GNT-VA 或 GNT-VB 的中国仓鼠卵巢细胞获得了结合 L-植物血凝素的能力,证实这两种酶都能合成 N-连接的 β-1,6-支链聚糖。
脑糖蛋白含有 O-连接的甘露糖残基,并具有 2-单-和 2,6-二-取代的 GlcNAc。稻盛和夫等人(2004) 表明,与 POMGNT1(606822) 配合,GNT-IX 可以在合成的脑型 O-甘露糖基肽上形成 2,6 分支结构。
▼ 基因结构
金子等人(2003)确定MGAT5B基因含有16个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Inamori 等人(2003) 和 Kaneko 等人(2003) 将 MGAT5B 基因定位到染色体 17q25.3。