锌指蛋白 197; ZNF197

锌指蛋白 20; ZNF20

此条目中涉及的其他实体:
包含 VHL 相关 KRAB——一种域包含的蛋白质; VHLAK,包括

HGNC 批准的基因符号:ZNF197

细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:44,625,036-44,648,471(来自 NCBI)

▼ 说明

ZNF197 编码含有多个 C2H2 型锌指基序的蛋白质(Gonsky et al., 1997)。 ZNF197 的选择性剪接产生 VHLAK,它缺乏锌指基序并与 VHL(608537) 相互作用,负向调节 HIF1-α(HIF1A; 603348) 反式激活(Li et al., 2003)。

▼ 克隆与表达

彭格等人(1993) 分离出人类 ZNF197 的部分 cDNA,他们将其命名为 D3S1363E。人体组织的 Northern 印迹分析检测到主要在骨骼肌中表达。

贡斯基等人(1997) 从人乳头状甲状腺癌细胞系 cDNA 文库中克隆了全长 ZNF197,他们将其命名为 ZNF20。推导的 1,029 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 118.9 kD,包含 20 个 C2H2 型锌指基序和多个磷酸化位点。

通过酵母 2-杂交分析来鉴定 VHL 相互作用蛋白,随后进行 RACE,Li 等人(2003) 克隆了人类 ZNF197 剪接变体,并将其命名为 VHLAK。 ZNF197 转录物在其 3 引物末端含有外显子 6,而 VHLAK 转录物缺乏外显子 6,并在其 3 引物末端具有外显子 7。推导的 VHLAK 蛋白含有 267 个氨基酸,预测分子量为 30 kD。 ZNF197 和 VHLAK 均具有 SCAN 结构域和 KRAB-A 结构域,但 ZNF197 在其 C 末端具有 22 个 C2H2 型锌指基序,而 VHLAK 中不存在。 Northern blot、RT-PCR和EST数据库分析表明ZNF197和VHLAK在人体组织中广泛表达。 HeLa 细胞的蛋白质印迹分析揭示了对应于 ZNF197 的 120 kD 条带和对应于 VHLAK 的 35 kD 条带。

▼ 基因功能

使用下拉分析,Li 等人(2003)表明人类VHLAK的KRAB-A结构域与VHL相互作用。 COS-7 细胞中的表达分析表明,VHLAK 的 KRAB-A 结构域表现出孤立于组蛋白脱乙酰酶活性的转录抑制活性。哺乳动物 2-杂交测定表明,VHLAK 通过其 SCAN 结构域同源寡聚化,并且这种寡聚化增强了 KRAB-A 结构域的抑制活性。 HEK293 和 A498 细胞中的免疫沉淀和表达分析表明,VHL 通过将 VHLAK 招募到 HIF1-α 来抑制 HIF1-α 的反式激活和 HIF1-α 诱导的 VEGF(192240) 表达。 Pull-down 测定表明,VHLAK 通过其 KRAB-A 结构域同时结合 VHL 和 KAP1(TRIM28;601742)。

▼ 基因结构

李等人(2003) 确定 ZNF197 基因跨度为 23 kb,包含 7 个外显子。外显子 6 和 7 进行选择性剪接。

▼ 测绘

通过对 YAC 重叠群的分析,Pengue 等人(1993) 将 ZNF197 基因定位到染色体 3p21。