无 ECDYSONEL 细胞周期调节剂; ECD

ECDYSONELESS,果蝇,同源物
GCR2 抑制剂; SGT1

HGNC 批准的基因符号:ECD

细胞遗传学位置:10q22.2 基因组坐标(GRCh38):10:73,133,668-73,168,095(来自 NCBI)

▼ 说明

ECD 是一种参与细胞周期停滞和细胞凋亡的转录激活剂(Suh et al., 2013)。

▼ 克隆与表达

Sato 等人通过筛选人脑 cDNA 表达文库,寻找可补充糖酵解转录因子 Gcr2 缺陷的酵母的克隆(1999) 克隆了 ECD,他们将其称为 SGT1。推导的 644 个氨基酸的蛋白质富含酸性残基,并且在 C 末端附近有 2 个卷曲区域。 Northern 印迹分析检测到在所有 8 个人体组织中主要 2.4-kb SGT1 转录物和次要 3.2-kb 转录物的可变表达。 EST 数据库分析表明 SGT1 广泛表达,并且存在替代剪接变体。

金等人(2010)发现,在转染的U2OS骨肉瘤细胞中,人ECD在细胞质和细胞核之间穿梭,主要定位在细胞质中。

▼ 基因功能

通过领域分析,佐藤等人(1999) 发现 Gcr2 缺失酵母的补充需要人类 SGT1 的转录活性和糖酵解酶活性的恢复。

Kim 等人使用报告基因检测(2010) 发现人 ECD 在转染的 U2OS 细胞中具有剂量依赖性反式激活活性。 ECD 与组蛋白乙酰转移酶 p300(EP300;602700)的共表达进一步增加了 ECD 对报告基因的反式激活。免疫沉淀分析表明,表位标记的 ECD 与表位标记的 p300 相互作用,并且通过反向测定证实了这种相互作用。 ECD 缺失和点突变分析揭示了 C 端反式激活结构域,需要 asp484 和 leu489 才能发挥活性。截短突变还揭示了残基 481 和 497 之间潜在的核输出信号。

Suh 等人使用酵母 2-杂交筛选和蛋白质相互作用测定(2013) 表明内源性人 ECD 直接与 TXNIP(606599) 相互作用,对细胞增殖和凋亡具有多种影响。 ECD 和 TXNIP 的过表达(单独或一起)抑制 MDM2(164785) 与 p53(TP53;191170) 的结合,减少 MDM2 依赖性 p53 泛素化并增加 p53 稳定性和活性。 ECD 或 TXNIP 的过表达还以 p53 依赖性方式增加人细胞系中放线菌素 D 介导的细胞死亡。相反,敲低 ECD 或 TXNIP 会减少 p53 依赖性细胞死亡。

通过质谱分析,Saleem 等人(2021) 表明 ECD 与 DDX39A(619906) 及其相关的核输出蛋白复合物相互作用。 ECD及其与DDX39A的相互作用是DDX39A依赖性mRNA从细胞核到细胞质的输出所必需的,但ECD也发挥了DDX39A本身无法实现的独特作用。数据库分析显示,ECD 在乳腺癌(114480) 患者中过度表达,尤其是 ERBB2(164870) 阳性乳腺癌患者,且 ECD 过度表达与不良预后特征和较短的生存期相关。 ERBB2 mRNA从细胞核到细胞质的加工需要ECD,并且在ERBB2过表达的乳腺癌细胞中需要最佳的ECD表达。

▼ 测绘

Hartz(2015) 根据 ECD 序列(GenBank D88208) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ECD 基因对应到染色体 10q22.2。