纤毛和鞭毛相关蛋白 52； CFAP52

WD 重复序列蛋白 16； WDR16
WD40 重复含有蛋白在肝细胞癌中表达上调； WDRPUH

HGNC 批准的基因符号：CFAP52

细胞遗传学位置：17p13.1 基因组坐标（GRCh38）：17:9,576,642-9,645,554（来自 NCBI）

▼ 说明

含有 WD 重复序列的蛋白质，例如 WDR16，在多种生理功能中发挥着至关重要的作用，包括信号转导、RNA 加工、细胞骨架重塑、囊泡转移调节和细胞分裂（Silva 等，2005）。

▼ 克隆与表达

Silva 等人使用 cDNA 微阵列分析来识别肝细胞癌（HCC） 中上调的基因，然后进行睾丸 mRNA 的 5-prime RACE（2005） 克隆了 WDR16，他们将其命名为 WDRPUH。 WDR16 包含 11 个 WD40 重复结构域，与小鼠、大鼠和猴子 Wdr16 蛋白具有 84% 至 89% 的氨基酸同一性。对 16 种人体组织的 Northern 印迹分析仅在睾丸中检测到 2.2 kb WDR16 转录物。免疫荧光定位在转染的人类细胞系的细胞质中检测到 WDR16。

通过免疫印迹分析，Dougherty 等人（2020） 在人类和小鼠的呼吸细胞和精子样本裂解物中检测到全长 CFAP52。作者指出，在呼吸道中可检测到较小的 CFAP52 同工型，但在精子裂解物中却未检测到。

Contreras 和 Hoyer-Fender（2020） 指出，小鼠 Cfap52 基因产生 3 个剪接变体，分别编码 620、577 和 342 个氨基酸的亚型。 2 个最长的异构体包含 2 个 WD 重复区域和 5 个 WD 重复区域 2，而最短的异构体包含 1 个 WD 重复区域和 1 个 WD 重复区域 2。 RT-PCR 分析显示，Cfap52 在小鼠组织中表达较低但普遍存在，表达不限于运动纤毛细胞。 Cfpa52 定位于小鼠睾丸细胞悬浮液中的精子细胞 manchette 和精子尾部。在 NIH3T3 细胞中，Cfap52 定位于中心体、基体、细胞间桥和纺锤体极。免疫荧光分析显示，所有 3 种 Cfap52 亚型均定位于转染的 NIH3T3 细胞的中心体。突变分析揭示了 Cfap52 蛋白 N 末端区域的中心体靶向序列。

▼ 基因结构

席尔瓦等人（2005） 确定 WDR16 基因包含 14 个外显子，跨度约为 60 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Silva 等人（2005） 将 WDR16 基因定位到染色体 17p13.1。

Contreras 和 Hoyer-Fender（2020） 指出，小鼠 Cfap52 基因对应到染色体 11B3。

▼ 基因功能

通过微阵列分析，Silva 等人（2005） 发现 WDR16 在 12 个 HCC 中的 11 个中过度表达。 RT-PCR 显示 WDR16 在另外 10 个 HCC 组织中的 8 个过表达。针对 WDR16 的小干扰 RNA 显着降低 HCC 细胞中 WDR16 的表达并导致生长抑制。通过免疫沉淀蛋白的质谱分析，Silva 等人（2005） 发现 WDR16 直接与 HSP70（参见 140550）、BRCA2（600185） 和 CCT1-δ（CCT4; 605142） 相互作用。

多尔蒂等人（2020） 证明重组 CFAP52 以异构体特异性方式从 HEK293 细胞中免疫沉淀 CFAP45（605152）。此外，他们还观察到 CFAP52 在几种遗传上不同类型的 DNAH11（603339） 突变纤毛中异常或检测不到。作者得出结论，CFAP45 和 CFAP52 之间存在物理遗传相互作用，并与动力蛋白 ATPase DNAH11 进行功能合作。

▼ 分子遗传学

Ta-Shma 等人在患有内脏异位（HTX10; 619607） 的巴勒斯坦姐妹和兄弟中，其中一个患有腹部反位，另一个患有全位反位（2015） 鉴定了 CFAP52 基因（609804.0001） 中外显子 2 缺失的纯合性。该突变随家族中的疾病而分离，并且在 22 个种族匹配的对照中未发现。

Dougherty 等人从 118 名疑似运动性纤毛病患者的队列中排除了原发性纤毛运动障碍（PCD）（2020） 鉴定了 4 名不相关的患有全反位和 CFAP52 基因突变的患者：2 名是先前确定的外显子 2 缺失（609804.0001） 的纯合子，1 名是 1 bp 缺失的纯合子（609804.0002），1 名是 1 bp 缺失的纯合子（609804.0002）。错义突变（G271R；609804.0003）。其中一名患者（OI-81）是一名 51 岁男性，也患有不孕症。

▼ 动物模型

在涡虫 Schmidtea mediterranea（Smed） 中，Dougherty 等人利用腹侧表面的纤毛表皮细胞进行运动（2020） 证明，RNAi 对 Smed-cfap52 的强烈消耗会显着损害粘性介质中的运动。然而，通过透射电镜观察，它们的纤毛超微结构显示正常，具有典型的9+2微管组织。

▼ 等位基因变异体（3 个选定示例）：

.0001 异位性，内脏，10，常染色体，男性不育
CFAP52、EX2 DEL

Ta-Shma 等人在患有内脏异位（HTX10; 619607） 的巴勒斯坦姐妹和兄弟中，其中一个患有腹部反位，另一个患有全位反位（2015）进行了纯合性作图和全外显子组测序，但没有发现与疾病分离的致病变异。然而，覆盖分析显示，CFAP52 基因的外显子 2 在患者中根本没有被覆盖，但在对照组中被深度覆盖。 cDNA 分析证实了一个异常短的片段，其中外显子 2 发生跳跃（c.70+1535_270+360del，NM_145054），导致移码，预计会导致过早终止密码子（His25ArgfsTer8）。多重连接依赖性探针扩增分析证实了该家族中缺失的分离，其未受影响的表亲和2名健康同胞的缺失是杂合的，而在22个种族匹配的对照中未发现这种缺失。作者通过连续 PCR 扩增了 448 bp 基因组片段，并对片段进行 Sanger 测序，确定了确切的断点（chr17:9481617_9489649del8033, GRCh37）。

Dougherty 等人在一名患有全反位的 51 岁男性（OI-81） 和一名无关的 18 岁女性（OI-140） 中进行了研究（2020） 鉴定了先前报道的 CFAP52 基因中外显子 2 缺失的纯合性。在 1000 Genomes 或 gnomAD 数据库中未发现该删除；没有关于家庭隔离的报道。免疫荧光显微镜证实存在于对照呼吸道纤毛中的 CFAP52 的全轴染色在患者呼吸道纤毛中检测不到。先证者 OI-81 也报告不育；精子分析未见报道。

.0002 异序、内脏、10、常染色体
CFAP52，1-BP DEL，1304G（rs1360832162）

在一名患有全反位（HTX10; 619607） 的 15 岁男孩（OI-142） 中，Dougherty 等人（2020） 鉴定出 CFAP52 基因中 1 bp 缺失（c.1304delG, NM_145054.4） 的纯合性，导致移码，预计会导致提前终止密码子（Gly435AlafsTer7）。尚未报道该变异的家族分离。该变体在千人基因组计划和 gnomAD 数据库中以非常低的次要等位基因频率出现（MAF，0.000004）。免疫荧光显微镜证实存在于对照呼吸道纤毛中的 CFAP52 的全轴染色在先证者的呼吸道纤毛中检测不到。

.0003 异序、内脏、10、常染色体
CFAP52，GLY271ARG（rs140921334）

在一名患有全反位（HTX10; 619607） 的 9 岁男孩（OI-161） 中，Dougherty 等人（2020） 鉴定了 CFAP52 基因中 c.811G-A 转换（c.811G-A, NM_145054.4） 的纯合性，导致 gly271 到 arg（G271R） 取代。尚未报道该变异的家族分离。免疫荧光显微镜证实存在于对照呼吸道纤毛中的 CFAP52 的全轴染色在先证者的呼吸道纤毛中检测不到。