mRNA 预加工因子 19; PRPF19
前体 mRNA 加工因子 19,酿酒酵母,同源物; PRP19
补骨素 4
PSO4,酿酒酵母,同系物; PSO4
核基质蛋白 200; NMP200
HGNC 批准的基因符号:PRPF19
细胞遗传学位置:11q12.2 基因组坐标(GRCh38):11:60,890,547-60,906,585(来自 NCBI)
▼ 说明
PSO4 是酵母 Pso4 的人类同源物,酵母 Pso4 是细胞生存和 DNA 修复所必需的基因(Beck 等,2008)。
▼ 克隆与表达
Mahajan 和 Mitchell(2003) 在 Pull-down 测定中使用重组全长 TDT(187410) 或包含 BRCT 结构域的截短 TDT 肽(参见 BRCA1;113705),从 2 个淋巴细胞系的全细胞提取物中分离出 PSO4。通过对肽片段进行测序、搜索数据库和 RT-PCR,他们从 Molt-4 前 T 淋巴瘤细胞系中克隆了 PSO4。推导的 504 个氨基酸蛋白具有 N 端 U 框和 6 个 C 端 WD40/β-转导蛋白(139380) 样重复。 PSO4 与酿酒酵母 Pso4 具有 38% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析检测到 2.4 kb 转录物的普遍表达。 SDS-PAGE表明PSO4的表观分子量为55 kD。
▼ 基因功能
通过对 Molt-4 细胞提取物中的内源蛋白进行免疫共沉淀,Mahajan 和 Mitchell(2003) 证实 PSO4 与 TDT 相互作用。使用纯化的重组蛋白,他们表明相互作用是直接的。通过迁移率变化分析,Mahajan 和 Mitchell(2003) 确定 PSO4 结合双链 DNA,但不结合单链 DNA。 PSO4 很容易结合质粒 DNA 底物,包括闭环质粒 DNA,表明 PSO4 以序列无关的方式结合,并且不需要游离 DNA 末端进行结合。在正常人成纤维细胞系中,伽马射线照射和化学诱变剂可诱导 PSO4 表达 15 至 30 倍,但紫外线照射则不然。小干扰RNA诱导的PSO4表达缺失导致双链断裂累积、细胞凋亡以及DNA损伤后细胞存活率降低。
贝克等人(2008) 发现 PSO4 结合 SETMAR(609834) 并与 DNA 上的 SETMAR 形成稳定的复合物,并且电离辐射诱导复合物形成。在用 PSO4 小干扰 RNA 处理的人胚胎肾细胞中,SETMAR 未能定位 DNA 双链断裂并刺激 DNA 末端连接。贝克等人(2008) 得出结论,PSO4 与 SETMAR 形成稳定的复合物,并介导 SETMAR 与 DNA 损伤位点的关联。
使用 RNA Pull-down 测定和质谱分析,Zheng 等人(2016) 发现长基因间非编码 RNA-673(LINC00673; 617079) 与 PTPN11(176876) 相互作用,PTPN11(176876) 是一种通过激活 SRC(190090)-ERK(参见 176948)信号传导和抑制 STAT1(600555) 来促进细胞生长和增殖的蛋白质发信号。 RNA免疫沉淀测定证实了PTPN11与LINC00673的相互作用,促进了PTPN11的泛素化和降解。 LINC00673 与 E3 泛素连接酶 PRPF19 相互作用,似乎介导和加强 PTPN11 和 PRPF19 之间的相互作用,增强 PRPF19 介导的 PTPN11 泛素化和降解。
▼ 测绘
Gross(2016) 根据 PRPF19 序列(GenBank BC008719) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PRPF19 基因对应到染色体 11q12.2。