死框解旋酶 31; DDX31
死框多肽 31
蛋白质磷酸酶 1,调节亚基 25; PPP1R25
HGNC 批准的基因符号:DDX31
细胞遗传学位置:9q34.13 基因组坐标(GRCh38):9:132,592,997-132,669,983(来自 NCBI)
▼ 说明
DDX31 是一种参与核糖体 RNA 生物合成和细胞生长调节的核仁蛋白(Fukawa et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Fukawa 等人通过表达谱鉴定透明细胞肾细胞癌(RCC; 144700) 和 RCC 细胞系中上调的基因(2012) 确定了 DDX31。推导的全长 851 个氨基酸蛋白具有在 DEAD box 蛋白中保守的 ATP 依赖性 RNA 解旋酶结构域。数据库分析揭示了另外 2 个 DDX31 剪接变体,它们的 3 引物末端不同,编码含有 775 和 778 个氨基酸的亚型。 Northern 印迹分析显示正常人体组织(包括肾脏)中 DDX31 表达较低。半定量 RT-PCR 鉴定全长 DDX31 是透明细胞 RCC 组织和细胞系中的主要变异体。免疫组织化学分析检测到 DDX31 与核磷蛋白(NPM1;164040) 在 RCC 细胞系的核仁中共定位。
▼ 基因功能
Fukawa 等人使用相互免疫共沉淀分析(2012) 表明全长 DDX31 与 RCC 细胞中的 NPM1 相互作用。 DDX31 或 NPM1 的敲低会减弱核糖体前 RNA 的生物合成。 DDX31 的敲低也减少了细胞生长,同时 NPM1 从核仁易位到细胞质。细胞质 NPM1 结合 HDM2(MDM2; 164785),从而减少 HDM2 与 p53(TP53; 191170) 的结合并导致 G1 细胞周期停滞和凋亡。
▼ 基因结构
富川等人(2012)确定DDX31基因有20个外显子。外显子 16 至 19 进行选择性剪接。
▼ 测绘
Hartz(2015) 根据 DDX31 序列(GenBank AK023695) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 DDX31 基因对应到染色体 9q34.13。