核受体结合结构域蛋白 3; NSD3

WHSC1L1 基因; WHSC1L1

此条目中涉及的其他实体:
包含 NSD3/NUP98 融合基因

HGNC 批准的基因符号:NSD3

细胞遗传学位置:8p11.23 基因组坐标(GRCh38):8:38,269,704-38,382,271(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Angrand等人通过EST数据库检索小鼠Nsd1(606681)和人NSD2(WHSC1;602952)作为探针并筛选羊膜细胞cDNA文库(2001) 克隆了 WHSC1L1 的部分序列,他们将其称为 NSD3。他们通过5-prime RACE获得了全长cDNA。推导的 1,437 个氨基酸的蛋白质包含 2 个参与蛋白质-蛋白质相互作用的 PWWP 结构域、5 个在染色质相关蛋白中发现的 PHD 型锌指基序、一个 SAC(SET 相关富含 cys)结构域、一个 SET 结构域和一个C端C5HCH结构域。他们还鉴定了一种由选择性聚腺苷酸化和外显子剪接产生的变体,该变体编码推导的 645 个氨基酸肽。短亚型包含单个 PWWP 结构域。通过 PCR 分析,Angrand 等人(2001) 在 HeLa 细胞中发现了这 2 个变体,以及第三个 1,388 个氨基酸的肽。 WHSC1L1 在包含 SAC、SET 和 C5HCH 结构域的 700 个氨基酸块上分别与小鼠 Nsd1(606681) 和人 WHSC1(602952) 具有 68% 和 55% 的同一性。 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 8.5 kb 的转录物,其中在脑、心脏和骨骼肌中表达最高,在肝脏和肺中表达较低。

▼ 基因结构

安格兰德等人(2001) 确定 WHSC1L1 基因包含 24 个外显子,跨度超过 90 kb。

▼ 测绘

通过 FISH,Angrand 等人(2001) 将 WHSC1L1 基因定位到染色体 8p12。斯特克等人(2001) 在染色体 17q21 上发现了一个假基因(WHSC1L2P)。

▼ 分子遗传学

罗萨蒂等人(2002) 描述了一名患有与 t(8;11)(p11.2;p15) 相关的急性髓性白血病患者的 NUP98 基因(601021) 和 NSD3 基因之间的融合。 FISH 分析显示特定 BAC 的分裂,表明 8p11.2 处的融合伴侣是 NSD3。