EYES SHUT 同系物; EYS

EYES SHUT,果蝇,同源
SPACEMAKER; SPAM

HGNC 批准的基因符号:EYS

细胞遗传学位置:6q12 基因组坐标(GRCh38):6:63,719,980-65,707,226(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Abd El-Aziz 等人使用定位克隆方法鉴定 6 号染色体上色素性视网膜炎 25 区间的基因(RP25; 602772),然后进行 RT-PCR 和 RACE(2008) 鉴定了 EYS 基因。推导的 3,145 个氨基酸蛋白在其 N 端区域具有至少 21 个 EGF(131530) 样结构域,随后是 5 个 C 端 LamG(参见 LAMC1,150290)结构域,其间散布着更多 EGF 重复序列。对多种正常组织和细胞系的 cDNA 进行 PCR 分析,仅在视网膜和人视网膜母细胞瘤细胞系中检测到 EYS。对成熟猪视网膜的免疫组织化学分析检测到感光层中的 Eys。

科林等人(2008) 通过 RT-PCR 和 RACE 孤立分析了 RP25 基因座,并鉴定出包含 10,475 个核苷酸的大转录本,包括 3 引物非翻译区和聚腺苷酸尾。该转录物编码的蛋白质包含 3,165 个氨基酸,预计含有分泌到细胞外环境的信号肽、28 个 EGF 样结构域和 5 个层粘连蛋白 A G 样结构域。 BLAST 分析表明,该基因是果蝇“闭眼”基因的真正直系同源基因(eys) 基因,作者将人类基因命名为 EYS。对多种人体组织总RNA的RT-PCR分析表明,EYS基因在视网膜中大量表达。

▼ 基因结构

阿卜杜勒-阿齐兹等人(2008) 确定 EYS 基因包含 43 个外显子,跨度为 2.0 Mb。

科林等人(2008) 孤立确定 EYS 基因包含 44 个外显子,跨越近 2 Mb 的基因组 DNA。

▼ 进化

通过数据库分析,Abd El-Aziz 等人(2008) 在哺乳动物进化枝中鉴定出完整的 Eys 基因,包括单孔类动物和有袋类动物;然而,在犰狳、小棕蝠、牛和羊中,Eys 似乎被删除了。此外,小鼠、大鼠和豚鼠的 Eys 基因在阅读框内含有破坏。 PCR 和免疫组织化学分析证实小鼠体内不存在 Eys 表达。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Abd El-Aziz 等人(2008) 将 EYS 基因定位到染色体 6q12。

▼ 分子遗传学

阿卜杜勒-阿齐兹等人(2008) 分析了 10 个患有与 RP25 间隔相关的常染色体隐性遗传色素性视网膜炎的西班牙家族中 6q12 染色体 RP25 间隔内的 6 个预测基因(RP25; 602772),并鉴定了 EYS 基因中 6 个不同突变的纯合性或复合杂合性,其中包括 4 个突变5 个无关家族中的缺失和 2 个无义替换(参见,例如 612424.0001-612424.0004)。所有突变都会导致终止密码子过早出现。

科林等人(2008) 分析了 10 名患有常染色体隐性遗传色素性视网膜炎的先证者的 EYS 基因,并在 2 名患者中鉴定出无义突变(Y3156X; 612424.0005) 和 1 bp 缺失(612424.0006) 的纯合性。随后在来自 131 名不相关 RP 患者的另一先证者中发现了 Y3156X 突变,单倍型分析表明存在创始人效应。

▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):

.0001 色素性视网膜炎 25
EYS、17-BP DEL、NT2710

Abd El-Aziz 等人在患有色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的西班牙家庭的 2 名受影响成员中(2008) 鉴定了 EYS 基因外显子 17 中 17 bp 缺失(2710_2726del17) 的纯合性,预计会导致移码和提前终止(Asp904GlnfsTer17)。未受影响的母亲和 2 名未受影响的同胞的突变是杂合的,而在 200 名对照个体中未发现这种突变。

.0002 色素性视网膜炎 25
EYS,EX15-19DEL

Abd El-Aziz 等人在患有色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的西班牙家庭的 3 名受影响成员中(2008) 鉴定了 EYS 基因(2260-51191_2992+45990) 外显子 15 至 19 缺失的纯合性,预计会导致移码和过早终止(Ser754AlafsTer6)。在 200 名对照个体中未发现该缺失。

.0003 色素性视网膜炎 25
EYS、EX12DEL

Abd El-Aziz 等人在患有色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的西班牙家庭的 3 名受影响成员中(2008) 鉴定了 EYS 基因外显子 12 中大缺失(1767-24596_2023+238135) 的复合杂合性,预计会导致移码提前终止,以及 EYS 外显子 28 中的 5857G-T 颠换,导致 glu1953- to-ter(E1953X; 612424.0004) 替代。在 200 名对照个体中未发现这两种突变

.0004 色素性视网膜炎 25
EYS,GLU1953TER

Abd El-Aziz 等人讨论了 EYS 基因中的 glu1953-to-ter(E1953X) 突变,该突变在患有色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的家庭受影响成员中以复合杂合状态发现(2008),参见 612424.0003。

.0005 色素性视网膜炎 25
EYS,TYR3156TER

Collin 等人在 2 名患有常染色体隐性遗传性色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的同胞中(2008) 鉴定了 EYS 基因外显子 44 中 9468T-A 颠换的纯合性,预计会导致 tyr3156-to-ter(Y3156X) 取代,导致蛋白质的 10 个 C 端氨基酸截短,其中一些保存完好。作者随后对 131 名无关的 RP 患者进行了等位基因特异性 PCR,并在另一名先证者及其 2 名受影响的同胞中发现了 Y3156X 突变。微卫星和 SNP 分析显示,Y3156X 存在于两个家族的相同单倍型上,表明存在创始人效应。在未受影响的家庭成员中,该突变要么不存在,要么以杂合性存在,并且在来自种族匹配对照的 552 个等位基因中未发现。

.0006 色素性视网膜炎 25
EYS,1-BP DEL,6714T

Collin 等人在一名患有常染色体隐性遗传色素性视网膜炎(RP25; 602772) 的女性患者中(2008) 鉴定了 EYS 基因外显子 33 中 1 bp 缺失(6714delT) 的纯合性,预计会导致第二个层粘连蛋白 A G 样结构域内的移码和提前终止,从而去除 6 个 EGF 样和 3 个层粘连蛋白 A G类似的域。该患者视野严重狭窄,在法律上属于失明。