类克鲁伯因子 13; KLF13

晚激活 T 淋巴细胞 1 的 RANTES 因子; RFLAT1
FKLF2

HGNC 批准的基因符号:KLF1​​3

细胞遗传学位置:15q13.3 基因组坐标(GRCh38):15:31,326,835-31,435,665(来自 NCBI)

▼ 说明

KLF13 属于转录因子家族,包含 3 个经典锌指 DNA 结合域,由 2 个半胱氨酸和 2 个组氨酸(C2H2 基序)四面体协调的锌原子组成。这些转录因子与富含 GC 的序列以及相关的 GT 和 CACCC 框结合(Scohy 等,2000)。

▼ 克隆与表达

尽管许多基因在 T 细胞激活后早期被诱导,但有一些基因(如 RANTES(187011))在 T 细胞分化阶段被诱导。 RANTES 基因的 A 启动子区域结合 REL(例如 RELA,164014)以及非 REL 蛋白。 Song 等人使用西南印迹法对激活的外周血淋巴细胞(PBL) 的核提取物进行检测,并用 RANTES 启动子 A 和 B 位点的寡核苷酸进行探测(1999) 鉴定出仅在晚期激活阶段检测到的蛋白质。 Song 等人通过使用 3 串联 A 位点探针筛选第 5 天激活的 PBL 文库(1999) 获得了编码 KLF13 蛋白的 cDNA,他们将其命名为 RFLAT(晚期激活 T 淋巴细胞的 RANTES 因子)。推导的 228 个氨基酸蛋白包含 3 个连续的 TFIIIA(GTF3A; 600860) 样 C 端 DNA 结合锌指基序,与 SP1(189906)、SP3(601804) 和 BTEB(602902) 65% 至 73% 同源)。它的 N 末端前面有一段富含碱性氨基酸的序列,富含脯氨酸、丝氨酸和丙氨酸残基。 SDS-PAGE和Western blot分析表明KLF13表达为磷酸化的38-kD蛋白。 Northern 印迹分析显示 7.5-和 5.0-kb 转录物普遍表达,其中 PBL 和胸腺丰度最高。免疫荧光和Western blot分析显示KLF13定位于细胞核。

Asano 等人使用基于 KLF1(600599) 序列的简并 PCR 引物(2000) 从胎儿肝红系细胞中克隆了编码 KLF13 的 cDNA,基于其与 FKLF 的结构相似性,他们将其命名为 FKLF2(TIEG2; 603301)。通过 Northern 印迹分析,他们表明 KLF13 在骨髓和横纹肌中以 4.4-和 1.5-kb 转录本表达,但在所分析的其他 12 种人体组织中不表达。

Scohy 等人通过搜索与 SP1 的锌指 DNA 结合域相关的序列,然后筛选胎鼠肝脏 cDNA 文库(2000)克隆小鼠Klf13。与人类蛋白质一样,小鼠 Klf13 编码推导的 288 个氨基酸的蛋白质。小鼠和人类 KLF13 通过锌指结构域具有 98% 的氨基酸同一性,总体上具有 87% 的同一性。与 DNA 建立特异性接触的 3 个锌指中的每一个中的残基在 KLF13 中完全保守,表明小鼠和人类 KLF13 都能识别经典的 GC 框。 Klf13 还含有富含脯氨酸和丙氨酸的 N 末端区域。 RT-PCR 分析显示 Klf13 在所有检查的小鼠组织中都有表达,其中睾丸和肝脏中的水平最低。

▼ 基因功能

Song 等人的凝胶迁移结合分析(1999) 证明 KLF13 结合 A 和 A/B RANTES 启动子结合位点,但不单独结合 B 位点,并且 NFKB(164011) 也结合这些位点。 Northern 和 Western blot 分析表明,虽然在静息和激活的 T 细胞中,KLF13 mRNA 在恒定稳态水平下可检测到,但 KLF13 蛋白仅在激活后较晚才出现。荧光素酶报告基因检测显示 KLF13 可以反式激活 RANTES 基因; KLF13 是 T 细胞中 RANTES 的主要反式激活因子,而 RELA 是成纤维细胞中的主要反式激活因子。

Asano 等人进行的荧光素酶报告基因检测(2000) 表明 KLF13 主要激活 γ-(HBG1; 142200) 珠蛋白基因启动子,并在较小程度上激活 ε-(HBE1; 142100) 和 β-(HBB; 141900) 珠蛋白基因启动子。他们发现 KLF13 参与红系细胞中多种基因的转录激活,包括 GATA1(305371)、血型糖蛋白 B(617923)、亚铁螯合酶(612386)、胆色素原脱氨酶(HMBS; 609806) 和 5 -氨基乙酰丙酸合酶(125290)。

▼ 测绘

Scott(2000) 根据 KLF13 序列(GenBank AF150628) 和 15 号染色体克隆(GenBank AC009873) 之间的序列相似性,将 KLF13 基因对应到 15 号染色体。通过体细胞杂交分析,Scohy 等人。 Suske 等(2000) 将 KLF13 基因对应到 15 号染色体(2005) 指出,人类 KLF13 基因对应到染色体 15q13.2,小鼠 Klf13 基因对应到染色体 7C。