蛋白酶体亚基,α 型,6; PSMA6
蛋白酶体亚基 IOTA
PROS27
p27K
HGNC 批准的基因符号:PSMA6
细胞遗传学位置:14q13.2 基因组坐标(GRCh38):14:35,278,558-35,317,493(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
德马蒂诺等人(1991) 克隆了一种新型蛋白酶体亚基 PSMA6 的部分序列,他们将其命名为“iota”。贝伊等人(1993) 克隆了编码一种蛋白质的 PSMA6 cDNA,他们将其命名为 p27K。推导的 246 个氨基酸的多肽包含 RNA 结合基序、推定的核定位信号和磷酸化位点。 PSMA6 与约 120 个核苷酸的特定 HeLa 细胞 RNA 结合。 Northern 印迹分析显示 PSMA6 在 HeLa 细胞中表达为 1.1-kb mRNA。 Southern 印迹分析显示的模式表明 PSMA6 是单拷贝基因。
库克斯等人(1996)回顾了20S蛋白酶体亚基的结构和功能。 α 亚基包含蛋白酶体的外环。一些α亚基含有功能性核定位信号;蛋白酶体存在于细胞的核和细胞质区室中。 α亚基可能构成限制胞质蛋白进入内部蛋白水解室的物理屏障。
▼ 测绘
贝伊等人(1993) 通过荧光原位杂交将 PSMA6 基因定位到染色体 14q13。
▼ 分子遗传学
由于炎症在心肌梗塞(608446) 的发病机制中至关重要,并且调节炎症过程的机制之一是泛素-蛋白酶体系统,Ozaki 等人(2006) 研究了 20S 蛋白酶体的变体是否与心肌梗塞的易感性相关。他们在 PSMA6 基因(602855.0001) 中发现了一个常见的 SNP(rs1048990;次要等位基因频率为 0.35),该 SNP 与日本人群的心肌梗塞显着相关。 SNP 增强了 PSMA6 的转录。此外,在培养细胞中使用短干扰 RNA 抑制 PSMA6 表达,可通过稳定磷酸化 I-kappa-B(参见 164008)来减少转录因子 NF-kappa-B(参见 164011)的激活。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 心肌梗塞,易感性
PSMA6、-8C-G、5-PRIME UTR(rs1048990)
尾崎等人(2006) 发现日本人群对心肌梗塞(608446) 的易感性与 PSMA6 基因外显子 1 的 5-prime UTR 中的 -8C-G SNP(rs1048990) 存在显着关联。 SNP 增强了 PSMA6 的转录。
日野原等人(2009) 分析了来自日本和韩国人群的总共 1,330 名冠状动脉疾病(CAD) 患者和 2,554 名对照者的 -8C-G 多态性,但没有发现相关证据。然而,对本研究和早期研究数据的荟萃分析得出 G 等位基因的比值比为 1.08(p = 0.0057),表明 PSMA6 对 CAD 的贡献不够大,无法轻易复制。日野原等人(2009) 得出的结论是,需要进一步研究来确定该变异对 CAD 易感性的影响。