LCK 相互作用跨膜转换因子 1

LIME

HGNC 批准的基因符号:LIME1

细胞遗传学位置:20q13.33 基因组坐标(GRCh38):20:63,735,701-63,739,103(来自 NCBI)

▼ 说明

LIME1 是一种筏相关跨膜转换因子磷蛋白,优先在造血细胞,特别是 T 细胞中表达(Brdickova 等,2003;Hur 等,2003)。

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索具有筏靶向跨膜转换因子蛋白结构特征的蛋白质,Brdickova 等人(2003) 确定了石灰。预测的 295 个氨基酸的 III 型蛋白具有 4 个氨基酸的胞外肽、一个 23 个氨基酸的跨膜结构域(紧随其后的是潜在的棕榈酰化基序(CxxC) 和 2 个 arg 残基)以及一个具有 5 个潜在酪氨酸的胞质结构域磷酸化位点。 RT-PCR 分析检测了 LIME 在肝脏、胸腺、外周血淋巴细胞(PBL) 和其他淋巴组织中的表达。 Western blot 分析显示,在 PBL 中,LIME 主要在 CD4(186940) 和 CD8(参见 186910) T 细胞中表达,并且在 T 细胞激活后下调。共聚焦显微镜、生物合成标记和蛋白质印迹分析证明了膜表达以及与脂筏的关联。

Hur 等人使用 LCK(153390) 的 SH2 和激酶结构域作为诱饵进行酵母 2 杂交分析(2003) 克隆小鼠 Lime。他们通过数据库分析获得了人类序列。小鼠组织的 Northern 印迹分析显示在脾和肺中表达,人体组织的 Northern 印迹分析显示在脾和 PBL 中表达。蛋白质印迹分析检测到大约 30 kD 的蛋白质。免疫荧光显微镜显示 LIME 定位于膜筏,并在与抗原呈递细胞接触后分布在免疫突触内。

▼ 基因功能

布尔迪科娃等人(2003) 发现 CD4 或 CD8 受体的参与诱导了 LIME 的酪氨酸磷酸化,这是由 Src 激酶(主要是 LCK 或 LYN)介导的(165120)。他们得出的结论是,LIME 参与了辅助受体对 T 细胞激活的调节。

Hur 等人使用蛋白质印迹分析(2003) 证明 LIME 参与 T 细胞中 ERK(参见 176948)和 JNK(参见 601158)途径的激活。此外,T 细胞中 LIME 的过度表达诱导 IL2(147680) 启动子活性。胡尔等人(2003) 得出结论,LIME 是一种筏相关跨膜转换因子蛋白,通过与 LCK 的关联将 T 细胞受体刺激与下游信号传导途径连接起来。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 LIME1 基因定位到 20 号染色体(RH75350)。