外泌体成分 4; EXOSC4
核糖体 RNA 加工蛋白 41,酿酒酵母,同源物;RRP41
HGNC 批准的基因符号:EXOSC4
细胞遗传学位置:8q24.3 基因组坐标(GRCh38):8:144,064,056-144,080,648(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
本质上不稳定的哺乳动物 mRNA 在其 3 素非翻译区内含有富含 AU 的元件(ARE)。在酵母中,3-prime-to-5-prime mRNA 降解是由外泌体(一种多亚基颗粒)介导的。陈等人(2001) 通过质谱法纯化并表征了人类外泌体,发现其组成与其酵母对应物相似。他们在人外泌体中鉴定出了以下蛋白质亚基:p7,与酵母 Rrp4 蛋白(602238) 同源; p8,与酵母 Rrp42 蛋白(606488) 同源; p9,与酵母 Rrp43 蛋白同源(OIP2;606019); p10,与酵母 Rrp40 蛋白(606489) 同源; p11,与酵母 Mtr3 蛋白(606490) 同源; p12A,与酵母Rrp41蛋白同源; p12B,与酵母 Rrp46 蛋白(606492) 同源;和 p13,它与酵母 Csl4 蛋白(606493) 同源。他们还鉴定了 2 个外泌体相关因子 p1(600478) 和 p14(MPP6; 605500),它们与任何酵母外泌体成分均不同源。
Brouwer 等人通过在 EST 数据库中搜索酵母外泌体成分的同源物,然后对畸胎癌细胞系进行 PCR 并使用胎盘 RNA 进行 5-prime RACE(2001) 分离出编码 RRP40、RRP41 和 RRP46 的 cDNA。推导的 245 个氨基酸的 RRP41 蛋白分别与小鼠和酵母序列有 96% 和约 40% 的同一性。 Western blot分析和免疫荧光显微镜显示27 kD蛋白在细胞核中表达,其中较大形式在细胞质中表达,在核仁中浓度最高。
▼ 基因功能
Chen 等人使用无细胞 RNA 衰减系统(2001) 证明哺乳动物外泌体是含 ARE RNA 的快速降解所必需的,但 Poly(A) 缩短则不需要。他们发现哺乳动物外泌体本身不能识别含有 ARE 的 RNA。 ARE 识别需要某些 ARE 结合蛋白,这些蛋白可以与外泌体相互作用并将其招募到不稳定的 RNA 上,从而促进它们的快速降解。
Brouwer 等人的泛函分析(2001) 支持这样的结论:RRP41 存在于人外泌体中,以具有 3-prime-to-5-prime 核酸外切酶活性的复合物的形式存在。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 EXOSC4 序列(GenBank AF281133) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 EXOSC4 基因对应到染色体 8q24.3。