CD6 抗原； CD6

T 细胞分化抗原 CD6

HGNC 批准的基因符号：CD6

细胞遗传学位置：11q12.2 基因组坐标（GRCh38）：11:60,971,680-61,020,377（来自 NCBI）

▼ 说明

CD6 是一种单体 105 kD 或 130 kD 膜糖蛋白，参与 T 细胞激活。两种 CD6 形式之间的大小差异是由于磷酸化的差异造成的（Robinson 等人，1995）。

▼ 克隆与表达

柘植等人（1985）通过单克隆抗体识别出分子量为 120 kD 的 T 细胞抗原 Tp120。该抗原在所有 T 细胞上表达。

Aruffo等人通过用抗CD6抗体筛选人外周血急性淋巴细胞白血病细胞cDNA表达文库（1991）克隆了编码CD6的cDNA。预测的 468 个氨基酸蛋白包含 24 个氨基酸信号序列、3 个胞外“富含半胱氨酸的清道夫受体”序列（SRCR）结构域（参见 CD5L；602592）、跨膜结构域和 44 个氨基酸的胞质结构域（参见 Robinson 等，1995）。它与 CD5（153340）显示出显着的同源性。通过 Northern 印迹分析，CD6 在 T 细胞中表达为大约 3 kb 的 mRNA。

罗宾逊等人（1995）通过用人 CD6 cDNA 筛选胸腺 cDNA 文库，克隆了小鼠 Cd6 cDNA。预测的 665 个氨基酸的小鼠蛋白具有 243 个氨基酸的胞质结构域。通过Northern印迹分析，小鼠Cd6主要在胸腺、淋巴结和脾脏中表达。作者指出，人类 CD6 主要在外周 T 细胞和成熟髓质胸腺细胞中表达。

由于人 CD6（44 个氨基酸；Aruffo 等人，1991）和小鼠 CD6（243 个氨基酸；Robinson 等人，1995）的细胞质结构域之间存在明显的大小差异，Robinson 等人（1995）对人外周血淋巴细胞 mRNA 使用 RT-PCR 来分离包含人 CD6 C 末端编码区的 cDNA 克隆。由 Aruffo 等人分离的 5 引物序列组成的杂合 cDNA（1991）和作者分离出的最长的 3-prime 序列编码了一个预测的 668 个氨基酸的蛋白质，在细胞质结构域中含有额外的 200 个氨基酸。针对来自表达杂合 cDNA 的细胞的 CD6 免疫沉淀单体 105-和 130-kD 蛋白质的抗体；这两种蛋白质在平行实验中与内源性 CD6 免疫沉淀发生共迁移。罗宾逊等人（1995）指出，内源性 CD6 的免疫沉淀并未显示出与包含 44 个氨基酸胞质结构域的预测 CD6 蛋白大小相对应的较小蛋白。作者鉴定了另外 2 个缺少编码胞质结构域近膜区域序列的 cDNA，并表明较短的 cDNA 代表选择性剪接的 CD6 转录本。

鲍文等人（1997）证实Aruffo等人分离的CD6 cDNA序列（1991）通过选择性剪接产生，他们鉴定了由编码细胞质结构域的外显子的可变剪接产生的额外mRNA。通过Northern印迹分析，这些选择性剪接的转录本并不是非常丰富。

▼ 基因功能

Joo 等人通过使用 CD6 融合蛋白进行免疫沉淀分析（2000）在上皮细胞和间充质细胞上鉴定出 2 个 CD6 配体、CD166（ALCAM; 601662）和 3A11。 Saifullah 等人使用 FACS 分析（2004）表明CD166和3A11在源自胸腺、皮肤、滑膜和软骨的多种上皮和间充质细胞系上以不同水平表达。 IFNG 增强了 3A11 的表达，但不增强 CD166（147570）。基于这些和其他发现，Saifullah 等人（2004）得出结论，3A11 和 CD166 是不同的 CD6 配体。

Enyindah-Asonye 等人利用质谱、蛋白质组学和免疫印迹分析（2017）确定单克隆抗体 3A11 识别 CD318（CDCP1; 611735）。 Pull-down 分析证实可溶性 CD6 结合 CD318。对野生型和 CD166 缺陷细胞的进一步分析和流式细胞术表明 CD6 与 CD318 和 CD166 相互作用。 CD318 在滑膜成纤维细胞和内皮细胞上表达，并分泌到类风湿关节炎（RA; 180300）或幼年炎性关节炎（见 604302）患者的滑液中，但不分泌到血清中，但不分泌到骨关节炎（OA; 见 165720）患者的滑液中。 CD318 参与滑膜组织中 T 细胞的募集和保留。用 IFNG 处理滑膜成纤维细胞导致 T 细胞不仅粘附到 CD166，而且粘附到 CD318。在诱导实验性自身免疫性脑脊髓炎后，与野生型小鼠相比，缺乏 Cd318 的小鼠中枢神经系统损伤和致病性 T 细胞浸润减少。恩因达-阿索尼耶等人（2017）得出结论，CD318 是 CD6 的配体，这种相互作用在自身免疫性疾病中很重要。

▼ 基因结构

鲍文等人（1997）报道 CD6 基因至少包含 13 个外显子，跨度超过 25 kb。

▼ 测绘

Tsuge 等人通过对人-小鼠体细胞杂交体的研究（1985）显示 11 号染色体与 Tp120 表达之间存在相关性。 LDHA（150000）的同工酶分析证实了人类11号染色体的存在。

鲍文等人（1997）通过荧光原位杂交测定，将 CD6 基因定位到 11q13 处的 YAC 重叠群。 CD6基因的位置接近相关基因CD5，Bowen等人提出（1997）表明这些基因源自共同的祖先基因。勒孔特等人（1996）发现小鼠 Cd6 和 Cd5 基因位于 19 号染色体近端相距小于 55 kb 的串联阵列中，该区域与人类 11q 显示同线性。

▼ 分子遗传学

De Jager 等人在对 2,624 名多发性硬化症患者（MS；126200）和 7,220 名对照者进行的全基因组关联研究的荟萃分析中，随后在一组孤立的 2,215 名多发性硬化症患者和 2,116 名对照者中进行了复制（2009）鉴定了几个新的 MS 易感性位点，包括 CD6 基因中的染色体 11q13（rs17824933）（p = 3.79 x 10（-9））。

通过 RT-PCR 和功能分析，Kofler 等人（2011）表明 CD6 基因内含子 1 中 rs17824933 的 MS 风险等位基因（G）与 CD4（186940）阳性和 CD8（参见 186910）阳性 T 细胞中全长 CD6 的表达降低相关。因此，来自具有风险等位基因的个体的 CD4 阳性 T 细胞的长期激活过程中，增殖会减弱。用外显子 5 特异性小干扰 RNA 敲低全长 CD6，在保护性等位基因纯合子个体中诱导了类似的缺陷（C）。来自具有风险等位基因的个体的 CD4 阳性 T 细胞表现出一致的 CD6 外显子 5 表达不足，该外显子编码蛋白质中的 ALCAM 结合位点。科夫勒等人（2011）得出结论，rs17824933 的 MS 风险等位基因与 CD4 阳性 T 细胞增殖的改变有关。