3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A裂解酶; HMGCL
HMG-CoA 裂解酶
HL
HGNC 批准的基因符号:HMGCL
细胞遗传学位置:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:23,801,885-23,825,429(来自 NCBI)
▼ 说明
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶 A 裂解酶催化 HMG-CoA 裂解为乙酰乙酸和乙酰-CoA,这是生酮和亮氨酸分解代谢的最后一步。它位于线粒体基质和过氧化物酶体中(Wang 等人总结,1996)。
▼ 克隆与表达
米切尔等人(1993) 对人和鸡肝 HMGCL 基因进行了克隆和测序。他们证明成熟的人羟甲基戊二酰辅酶A裂解酶有298个残基。人类克隆的序列预测了 27 个残基的线粒体前导序列和 31.6 kD 的成熟肽。人成纤维细胞和肝脏 RNA 包含一条 1.7 kb 的信息。王等人(1993) 克隆并表征了小鼠 Hmgcl cDNA。
▼ 测绘
王等人(1993) 将小鼠 Hmgcl 基因定位到 4 号染色体。他们通过分析人/仓鼠杂交细胞系,将人类 HMGCL 基因分配到 1 号染色体,并通过同位素原位杂交将其定位到 1pter-p33。
▼ 基因结构
Wang 等人使用小鼠 Hmgcl cDNA 作为探针(1996) 分离出一个含有全长小鼠基因的克隆,该基因跨越小鼠 4 号染色体约 15 kb,并包含 9 个外显子。小鼠基因的启动子区域包含管家基因的特征元件:包含多个 SP1 结合位点的 CpG 岛围绕着外显子 1,并且不存在 TATA 和 CAAT 框。他们在小鼠基因中发现了多个转录起始位点,位于翻译起始密码子上游 35 至 9 个碱基对处。小鼠和人类的基因高度同源。
▼ 分子遗传学
米切尔等人(1993) 描述了导致 HMG-CoA 裂解酶缺陷的 HMGCL 基因突变(HMGCLD; 246450);参见 613898.0001-613898.0002。
通过基因组 Southern blot 分析和外显子 PCR,Wang 等人(1996) 发现 33 个 HMGCL 缺陷先证者中有 2 个对于基因中不同的大缺失是纯合的(参见例如 613898.0003)。
室井等人(2000) 提出了对所有 5 例已知的日本 HMG-CoA 裂解酶缺乏症病例及其临床表型的分子分析结果。鉴定出五种不同的突变:1 个大缺失、1 个无义突变、1 个错义突变和 2 个剪接突变。在 1 名患者中发现 glu279-to-lys(613898.0005) 突变为纯合状态,在另一名患者中发现杂合状态;所有其他突变对于每个家族来说都是独特的。
▼ 动物模型
在对 HL 缺乏症中氧化还原稳态异常的综述中,Leipnitz 等人(2015)讨论了3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(HMG)、3-甲基戊二酸、3-甲基戊二酸和3-羟基异戊酸导致大鼠大脑皮层脂质过氧化。 HMG 的效果最为显着。只有 HMG 会引起大鼠肝脏中的脂质过氧化。
杨等人(2022) 开发了一种心肌细胞特异性 HL 缺陷小鼠。突变小鼠在 9 个月大时出现左心室心肌肥厚。注射 2-酮异己酸(一种亮氨酸代谢物)后,与野生型小鼠相比,突变小鼠出现短暂的左心室功能障碍,心脏中亮氨酸相关酰基辅酶 A 代谢物升高。突变小鼠肝脏中的酰基辅酶A谱与野生型小鼠的相同。杨等人(2022) 进一步证明,在肝脏特异性 HL 缺陷小鼠中,心脏酰基辅酶 A 水平与野生型小鼠相同。杨等人(2022) 得出结论,在 HL 缺乏的情况下,心脏和肝脏中会以器官自主的方式出现酰基辅酶 A 代谢异常。
▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):
.0001 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL、2-BP DEL、NT202
Mitchell 等人在一个阿卡迪亚法裔加拿大家庭中,有 2 名同胞出现低血糖和昏迷、尿有机酸以及典型的 HMG-CoA 裂解酶缺乏症(HMGCLD;246450) 的酶学结果(1992, 1993) 使用单链构象多态性(SSCP) 分析并检测到序列 CTCTCT(HMGCL cDNA 的核苷酸 202-207)内有 2 bp 缺失。该突变在丝氨酸 69 密码子 S69fs(-2) 内产生移码,从而产生截短的 78 个残基 HMG-CoA 裂解酶肽,其中 10 个残基中有 8 个与正常残基不同,预计将无功能。父母双方都是突变杂合子,受影响的同胞是纯合子。来自 9 个不同种族的其他 12 名裂解酶缺陷先证者均未表现出这种突变。魁北克省的一名法裔加拿大人患者中也不存在这种突变,该患者是 val70 至 leu 突变(V70L;613898.0002)和第二个尚未识别的等位基因的基因复合体。因此,在法裔加拿大人群中至少发现了 3 个突变等位基因。
.0002 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL,VAL70LEU
Mitchell 等人在魁北克省一名患有 HMG-CoA 裂解酶缺陷(HMGCLD; 246450) 的法裔加拿大患者中(1992) 发现 HMGCL 基因 208 号核苷酸处存在 G 到 C 颠换的复合杂合性,导致错义突变,其中正常的 val70 密码子被亮氨酸(V70L) 取代;另一个等位基因尚未确定。
.0003 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL、930-BP DEL、EX3-6DEL
通过基因组 Southern blot 分析和外显子 PCR,Wang 等人(1996) 发现 33 名患有 HMG-CoA 裂解酶缺陷的先证者(HMGCLD; 246450) 中的 2 名对于 HMGCL 基因中不同的大缺失是纯合的。在 1 名患者(HL29) 中,作者无法 PCR 扩增外显子 3 至 6(约 930 bp);在另一名患者(HL27) 中,外显子 2 至 6 难以扩增。他们还观察到,在 2 名患者的成纤维细胞中均未检测到 HMGCL 活性。
.0004 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL、ARG41GLN
在 9 名患有 HMG-CoA 裂解酶缺陷的沙特先证者中(HMGCLD;246450),Mitchell 等人(1998) 发现遗传多样性:6 个是 arg41 到 gln(R41Q) 错义突变的纯合子,2 个是 HMGCLD 中密码子 305 处 2 个核苷酸缺失导致移码的纯合子(Phe305fs(-2); 613898.0006)基因。米切尔等人(1998)使用细菌表达系统快速筛选HL突变蛋白的活性。他们指出,密码子 41 和 42 对于正常的 HMGCL 催化很重要,并且在 HL 缺陷先证者组中的 82 个突变等位基因中占了不成比例的 21 个(26%)。
.0005 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL、GLU279LYS
在已知的 5 名日本 HMG-CoA 裂解酶缺乏症患者(HMGCLD;246450) 中,Muroi 等人(2000) 发现 HMGCL 基因中的 835G-A 转变导致 glu279 到 lys(E279K) 氨基酸变化,占 10 个疾病等位基因中的 3 个。
.0006 HMG-CoA 裂解酶缺陷
HMGCL、2-BP DEL、TT、CODON 305
讨论 Mitchell 等人在 HMG-CoA 裂解酶缺陷(HMGCLD; 246450) 患者的复合杂合状态下发现的 HMGCL 基因(Phe305fs(-2)) 中的 2 bp 缺失(1998),参见 613898.0004。