异质核核糖核蛋白 D 样蛋白; HNRNPDL

HNRPDL
HNRPD 样蛋白
富含 AU 元素 RNA 结合因子
JKTBP

HGNC 批准的基因符号：HNRNPDL

细胞遗传学位置：4q21.22 基因组坐标（GRCh38）：4:82,422,564-82,430,462（来自 NCBI）

▼ 说明

异质核核糖核蛋白（HNRNP）形成蛋白质颗粒，与前 mRNA 结合并在剪接和核输出中发挥作用。有关 HNRNP 的更多背景信息，请参阅 HNRNPD（601324）。

▼ 克隆与表达

土井等人（1998）通过显示分化和未分化表型的白血病细胞克隆的差异展示，鉴定了 HNRPDL，他们将其称为 laAUF1。通过筛选未分化细胞文库并使用3-prime RACE，他们获得了编码推导的271个氨基酸蛋白质的cDNA，其中包含酪氨酸磷酸化位点、2个富含AU的元件（ARE）RNA结合基序和C端gln - 丰富的主题。 HNRPDL 与 AUF1（HNRPD）在包含 RNA 结合基序和富含 gln 基序的序列中具有 73% 同源性。 Northern 印迹分析显示转录物大小约为 1.5 和 2.4 kb。

Tsuchiya 等人使用称为 JKT41 的寡脱氧核苷酸（对应于髓过氧化物酶基因（MPO; 606989）的内含子 9 顺式作用元件）来筛选红白血病 cDNA 表达文库（1998）分离出编码 HNRPDL 的 cDNA，他们将其称为 JKT41 结合蛋白，或 JKTBP。预测的HNRPDL蛋白含有302个氨基酸。 Northern 印迹分析显示，大多数所检查的培养细胞都表达大约 1.4 和 2.8 kb 的 mRNA。

龟井等人（1999）鉴定了 HNRPDL 的 2 个亚型，他们将其称为 JKTBP1 和 JKTBP2，对应于 Tsuchiya 等人鉴定的 1.4-和 2.8-kb 转录本（1998），分别。较大的转录本预测为 420 个氨基酸的蛋白质，计算出的分子量约为 46.4 kD。 JKTBP2 蛋白具有更长的 N 末端，并且两种蛋白都包含多个潜在的磷酸化和精氨酸甲基化位点。 Northern印迹分析表明，两种转录物在所有检查的组织中均表达，尽管不同组织中转录物的数量和比例有所不同。三个大于 2.8 kb 的 JKTBP 转录本在胰腺、脾脏和胸腺中表达。骨髓性白血病细胞的蛋白质印迹分析显示蛋白质大小为 38 和 53 kD。

▼ 基因功能

土井等人（1998）确定在用白细胞介素 4（IL4; 147780）诱导增殖和用佛波酯 TPA 诱导分化后，白血病细胞中的 HNRPDL 表达下调。他们还发现重组 HNRPDL 融合蛋白对 FOS（164810）和 MYC（190080） ARE 底物具有相对较高的亲和力。

土屋等人（1998）确定重组 HNRPDL 与 JKT41 的双链和单链形式相互作用，JKT41 是一种对应于 MPO 基因内含子 9 中顺式作用元件的寡脱氧核苷酸。重组 HNRPDL 还与聚（G）和聚（A）相互作用，但不与聚（U）或聚（C）相互作用。 HNRPDL 的瞬时表达抑制了位于 JKT41 内含子 9 元件或 FERE27（另一种对应于 MPO 的寡脱氧核苷酸）内含子 7 元件下游的报告基因的表达。

▼ 基因结构

龟井等人（1999）确定 HNRNPDL 基因包含 9 个外显子，跨度约为 5.6 kb。 5 素侧翼区域显示 66% CG 含量和 8 个 SP1（189906）结合位点，但没有 CAAT 或 TATA 框。

▼ 测绘

作者：FISH，Kamei 等人（1999）将 HNRNPDL 基因定位到染色体 4q13-q21。

Gross（2014）根据 HNRNPDL 序列（GenBank BC011714）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 HNRNPDL 基因对应到染色体 4q21.22。

▼ 分子遗传学

Vieira 等人在患有常染色体显性肢带型肌营养不良症 3 型（LGMDD3；609115）的巴西家庭和乌拉圭家庭的受影响成员中，早期以 LGMD1G 为标志（2014）鉴定了影响 HNRNPDL 基因中相同密码子的不同杂合错义突变（分别为 D378N, 607137.0001 和 D378H, 607137.0002）。这些突变是通过连锁分析和全基因组测序的结合发现的。没有进行变体的功能研究。酵母同源物hrp1的丢失对蛋白质水平和细胞定位都有显着影响，表明它的丢失对细胞生理学有害。酵母蛋白质组上 Hrp1 的缺失揭示了参与 RNA 加工途径的蛋白质的戏剧性重组。一名患有严重疾病的巴西患者的骨骼肌活检显示出明显的肌病模式，伴有坏死纤维和边缘空泡，以及一些神经源性受累，如小角纤维、II 型纤维占主导地位和纤维类型分组所证明的那样。免疫组织化学研究显示，与对照相比，HNRNPDL 的核标记具有更高的变异性，一些细胞核显示出强烈的浓缩信号，而其他细胞核则显示出细胞核周围的扩散模式。

▼ 动物模型

维埃拉等人（2014）发现斑马鱼中 hnrpdl 的吗啡啉敲低会导致体型缺陷和尾巴扭曲，以及运动受限和不协调，与肌病一致。从突变斑马鱼中分离出的肌纤维是杂乱无章的。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 肌营养不良，肢带，常染色体显性 3
HNRNPDL、ASP378ASN

在患有常染色体显性肢带型肌营养不良症 1G 型（LGMDD3；609115）的巴西大型亲属中，最初由 Starling 等人报道（2004），维埃拉等人（2014）在 HNRNPDL 基因的外显子 6 中鉴定出杂合的 c.1667G-A 转换，导致高度保守的残基处由 asp378 替换为 asn（D378N）。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的，并通过桑格测序证实，与家族中的疾病分离。该突变根据 1000 个基因组计划和外显子组测序计划数据库进行筛选，在 604 个巴西对照中不存在该突变。在另一个患有该疾病的家族中发现了相同残基（D378H；607137.0002）的突变。没有进行变体的功能研究。

.0002 肌营养不良，肢带，常染色体显性 3
HNRNPDL、ASP378HIS

在患有常染色体显性肢带型肌营养不良症 1G 型（LGMDD3；609115）的乌拉圭大家族的受影响成员中，Vieira 等人（2014）在 HNRNPDL 基因的外显子 6 中发现了杂合的 c.1667G-C 颠换，导致高度保守的残基处由 asp378 替换为 his（D378H）。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的，并通过桑格测序证实，与家族中的疾病分离。该突变根据 1000 个基因组计划和外显子组测序计划数据库进行筛选，在 604 个巴西对照中不存在该突变。在另一个患有该疾病的家族中发现了相同残基（D378N；607137.0001）的突变。没有进行变体的功能研究。