WAP 4-二硫核心结构域1; WFDC1
前列腺基质蛋白,20-KD,大鼠,同系物; PS20
HGNC 批准的基因符号:WFDC1
细胞遗传学位置:16q24.1 基因组坐标(GRCh38):16:84,294,878-84,329,844(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
大鼠 ps20 蛋白最初被鉴定为分泌性生长抑制剂(Rowley,1992;Rowley 和 Tindall,1987),并从胎鼠泌尿生殖窦间充质细胞系中纯化至同质(Rowley 等,1995)。拉森等人(1998)克隆了大鼠cDNA,发现它含有WAP型4-二硫键核心基序,表明它可能具有蛋白酶抑制剂的功能。
Larsen 等人通过用部分大鼠 ps20 cDNA 克隆作为探针筛选人前列腺 cDNA 文库(2000)克隆了全长WFDC1 cDNA,编码包含WAP型4-二硫键核心基序的推导的220个氨基酸的蛋白质。他们还克隆了小鼠同源物,发现人类 WFDC1 蛋白与大鼠和小鼠蛋白分别具有约 86% 和 88% 的同一性。
▼ 基因结构
小鼠和人类 WFDC1 基因均包含 7 个外显子(Larsen et al., 1998)。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交(FISH),Larsen 等人(2000) 将 WFDC1 基因定位到染色体 16q24,这是癌症中经常发生杂合性丢失(LOH) 的区域,包括前列腺癌、乳腺癌、肝细胞癌和肾母细胞瘤。 LOH 与基因产物(ps20) 的生长抑制特性相结合,表明 WFDC1 是一种肿瘤抑制基因。 Larsen 等人通过在 FISH 分析中对端粒探针和 WFDC1 探针进行共杂交(2000) 发现 WFDC1 位于子带 16q24.3 中,距离端粒不到 2 Mb。
▼ 分子遗传学
萨弗罗伊等人(2002) 描述了一种使用 WFDC1 基因内含子 3 和 4 中鉴定的 2 个二核苷酸重复多态性检测 WFDC1 基因座处 LOH 的测定方法。在 40 个信息性肝细胞癌(HCC;114550) 样本中的 4 个(10%) 中观察到 LOH。对来自 LOH 和 5 个 HCC 细胞系患者的肿瘤样本进行了 WFDC1 基因编码外显子(外显子 1 至 4)突变的筛查,但未检测到导致氨基酸变化的核苷酸变化。此外,在肿瘤样本和肿瘤中表现出 LOH 的患者的相应非肿瘤肝脏之间没有观察到启动子甲基化存在显着差异。 WFDC1 基因表达在肿瘤、相应的非肿瘤和正常肝脏样本之间没有显着差异。这些结果并不支持 WFDC1 作为肿瘤抑制基因在 HCC 中的主要作用。