赖氨酸脱甲基酶8; KDM8

赖氨酸特异性脱甲基酶 8
Jumonji 结构域蛋白 5; JMJD5

HGNC 批准的基因符号:KDM8

细胞遗传学位置:16p12.1 基因组坐标(GRCh38):16:27,203,526-27,221,768(来自 NCBI)

▼ 说明

JMJD5 预计具有组蛋白脱甲基酶(参见 EC 1.14.11.27)和蛋白质羟化酶(Youn 等人,2012)的双重功能。

▼ 克隆与表达

JMJD5 包含 Jumonji C(JmjC) 结构域(Shi,2007)。

尤恩等人(2012) 发现 Jmjd5 在小鼠 RAW264 细胞的染色质和可溶性核部分中表达。

▼ 基因功能

Suzuki 等人使用 Blm(RECQL3; 604610) 缺陷小鼠进行插入诱变(2006) 将 Jmjd5 鉴定为假定的肿瘤抑制因子。通过 RNA 干扰敲低 Jmjd5 会增加小鼠成纤维细胞的突变率,并增加其对 DNA 甲基化剂 MNNG 的耐受性,表明 Jmjd5 可能在 DNA 错配修复中发挥作用。

Youn 等人使用实时 RT-PCR(2012) 发现 Jmjd5 表达在小鼠 RAW264 细胞的破骨细胞分化过程中下降。 Jmjd5 的敲低加速了破骨细胞的成熟。 Jmjd5 直接与破骨细胞转录因子 Nfatc1(600489) 相互作用并下调其转录活性。体外测定表明,Jmjd5 通过诱导 Nfatc1 C 末端结构域的羟基化、靶向 Nfatc1 与 E3 泛素连接酶 Vhl(608537) 相互作用以及蛋白酶体介导的降解来下调 Nfatc1。

马尔孔等人(2014) 发现 RCCD1(617997) 与组蛋白 H3(参见 602810)lys36 去甲基化酶 KDM8 相互作用。 HEK293 细胞中的实验表明,KDM8-RCCD1 复合物是 KDM8 去甲基化活性和 M 期卫星重复转录沉默所必需的。 RCCD1 和 KDM8 之间的相互作用可能是通过两种蛋白质的 N 末端区域介导的。 RCCD1 或 KDM8 的敲低导致多极纺锤体和 DNA 玫瑰花结的形成以及后期检查点的绕过。含有具有多个簇状中心体的纺锤体的细胞应该经历细胞凋亡,但敲低细胞却经历了不平衡的核分裂,导致染色体不稳定。

吴等人(2017) 发现 RCCD1 缺失显着损害人非小细胞肺癌(NSCLC;参见 211980) 细胞的迁移,上调乙酰化 α-微管蛋白的水平(参见 602529),并增加细胞骨架微管的稳定性。 RCCD1 通过与 KDM8 相互作用来调节细胞骨架微管的稳定性和细胞迁移,并可能抑制肺癌细胞中的 KDM8 功能。 RCCD1-KDM8 相互作用需要 RCCD1 的所有 4 个 RCC1 结构域和 KDM8 的氨基酸 1 至 150。微管稳定性的增加减弱了 TGF-β(TGFB1;190180)在 RCCD1 耗尽的 NSCLC 细胞中诱导的上皮间质转化,从而抑制了 TGF-β 诱导的细胞迁移。

威尔金斯等人(2018) 将 RCCD1 确定为 KDM8 的底物。作为人精氨酰 C3 羟化酶,KDM8 按 RCCD1 序列催化精氨酸的立体选择性 C3 羟化。

▼ 测绘

Hartz(2008) 根据 JMJD5 序列(GenBank AK225066) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 JMJD5 基因对应到染色体 16p12.1。