XPA 结合蛋白 1; XAB1
MBD2-相互作用蛋白; MBDIN
HGNC 批准的基因符号:GPN1
细胞遗传学位置:2p23.3 基因组坐标(GRCh38):2:27,628,247-27,651,511(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nitta 等人使用 XPA(611153) 作为酵母 2-杂交筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库的诱饵,然后重新筛选 HeLa 细胞文库以及胎盘和肺成纤维细胞 RNA 的 5-prime RACE(2000) 获得了全长 XAB1 克隆。推导的 374 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 41 kD。 N 端区域包含几个在 GTP 结合蛋白中保守的基序,C 端区域包含一簇酸性氨基酸。 Northern 印迹分析检测到主要 2.1-kb 转录物的普遍表达,其中在睾丸中表达最高。在多个组织中检测到了较小的 2.9-kb 转录物,仅在睾丸中检测到了较小的 1.4-kb 转录物。 HeLa 细胞的免疫荧光分析和分级分离的 HeLa 细胞的蛋白质印迹分析表明 XAB1 主要存在于细胞质中。数据库分析揭示了线虫、果蝇和酵母中的 XAB1 同源物。
Lembo 等人使用 MBD2(603547) 作为诱饵,对 HeLa 细胞 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,然后筛选乳腺癌 cDNA 文库(2003) 克隆了 XAB1,他们将其称为 MBDIN。他们在 MBDIN 的中心区域发现了核输出信号(NES)。
▼ 基因功能
通过突变分析,Nitta 等人(2000)表明XAB1特异性结合XPA的残基30至34。昆虫细胞中表达的XAB1具有GTPase活性,但不具有ATPase活性。
Lembo 等人使用缺失突变体(2003)表明,MBDIN 的 N 端 GTP 结合位点和 C 端区域都是其与 MBD2 C 端区域相互作用所必需的。 XPA、MBD2 和 MBDIN 在 293T 细胞中的共表达导致了它们的共免疫沉淀,结果表明 MBDIN 充当 MBD2 和 XPA 之间的桥梁。荧光成像实验表明,MBDIN 主要定位于细胞质中,但在破坏 NES 或抑制 NES 介导的转运时,它会在细胞核中积累。 MBDIN 与 MBD2 部分共定位于重甲基化卫星 DNA 的焦点处。缺乏 C 端区域的 MBD2 缺失突变体保持其亚核定位,但无法在高甲基化灶处招募 MBDIN。转录测定表明,MBDIN 缓解了 MBD2 介导的报告基因和体外甲基化启动子报告质粒的转录抑制。转录重新激活的发生没有改变启动子甲基化模式。
Jeronimo 等人使用亲和纯化、质谱分析和生物信息学分析(2007) 绘制了参与 RNA 聚合酶 II(参见 180660)机制的蛋白质复合物的相互作用网络。他们发现 RPAP1(611475)、RPAP2(611476)、RPAP3(611477) 和 XAB1 在 HEK293 细胞的可溶性核区室中与 RNA 聚合酶 II 紧密结合,并且用表位标记的 POLR2J(604150) 进行凝胶过滤证实 RPAP1 、RPAP3 和 XAB1 与 RNA 聚合酶 II 共分级。对蛋白质相互作用网络的检查表明,RPAP 和 XAB1 还与介体(例如,MED17;603810)和整合器(例如,INTS3;611347)复合物的成分以及能够组装成分子伴侣复合物的蛋白质相互作用,包括前折叠蛋白(例如 PFDN6;605660)和 AAA+ ATP 酶 RUVBL1(603449) 和 RUVBL2(604788)。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Nitta 等人(2000) 将 XAB1 基因定位到染色体 2p23.3。