蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体型,γ; PTPRG
蛋白质酪氨酸磷酸酶γ; PTPG
HGNC 批准的基因符号:PTPRG
细胞遗传学位置:3p14.2 基因组坐标(GRCh38):3:61,561,571-62,297,609(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
蛋白质酪氨酰残基磷酸化水平和模式的变化与细胞增殖的控制有关。细胞内的磷酸化水平是蛋白酪氨酸激酶和蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP) 的相反活性之间平衡的结果。已经出现了两类不同的 PTP:一类是细胞质 PTP,是小的可溶性蛋白质;另一类是细胞质 PTP。另一类是受体 PTP,是大型跨膜蛋白。卡普兰等人(1990)克隆了3个人类受体PTP基因。
巴尼亚等人(1993) 从大脑 cDNA 文库中克隆了人和小鼠 PTPRG 基因的 cDNA(他们用 RPTP-γ 表示),并分析了它们预测的多肽序列。人类(1,445 个氨基酸)和小鼠(1,442 个氨基酸)序列在氨基酸水平上具有 95% 的同一性,并预测假定的细胞外结构域、单个跨膜结构域和具有 2 个串联催化酪氨酸磷酸酶结构域的细胞质区域。胞外结构域包含一段 266 个氨基酸,与含锌酶碳酸酐酶(114800) 高度相似,表明 RPTP-γ 和 RPTP-β(PTPRZ; 176891) 代表受体酪氨酸磷酸酶的一个亚家族。
▼ 基因结构
为了促进肾肿瘤中 PTPRG 基因完整性的研究,Kastury 等人(1996) 确定了其结构及其相对于家族性 RCC 中鉴定的 3p14.2 易位断点的映射位置。该基因有 30 个外显子,大小约为 780 kb。它比其他受体 PTP 基因大得多,其中 CD45 基因(151460) 约为 100 kb,其他基因更小。
▼ 测绘
通过对保留整个人类基因组重叠子集的啮齿动物-人类体细胞杂交体的分析,LaForgia 等人(1991) 将 PTPG 基因定位到 3p21-p14。通过与定位到该区域的其他基因进行比较,他们得出结论,PTPG 位于 3p21 着丝粒带至 t(3;8) 染色体易位中的 3p 断点处。
拉蒂夫等人(1993)通过荧光原位杂交将PTPRG基因定位于3p14.2。通过使用 CEPH 谱系面板进行连锁分析,代表 PTPRG 基因座的 D3S1249 位于 D3S1187 和 D3S1188 之间,重组分数分别为 0.022 和 0.025(Tory 等,1992)。
卡斯图里等人(1996) 确定 PTPRG 基因的 5-prime 末端定位在与 RCC 相关的相互 t(3;8) 易位中的 3p14.2 断裂附近但着丝粒附近。 FHIT 基因(601153) 因该断裂而被破坏。
▼ 分子遗传学
拉福吉亚等人(1991)表明,在测试的 5 个肾癌细胞系中的 3 个和 10 个肺癌肿瘤样本中的 5 个中,有 1 个 PTPG 等位基因丢失。 PTPG mRNA 在肾细胞系和肺细胞系中表达,但在测试的几种造血细胞系中不表达。因此,PTPG基因似乎具有表明其作为肾癌和肺癌的候选肿瘤抑制基因的特征。
王等人(2004) 对人类癌症中的酪氨酸磷酸酶基因超家族进行了突变分析,并鉴定了 6 种蛋白酪氨酸磷酸酶中的 83 个体细胞突变(PTPRF, 179590;PTPRG;PTPRT, 608712;PTPN3, 176877;PTPN13, 600267;和 PTPN14, 603155 ),影响 26% 的结直肠癌以及一小部分肺癌、乳腺癌和胃癌。十五种突变是无义突变、移码突变或剪接位点改变,预计会导致缺乏磷酸酶活性的截短蛋白质。王等人(2004) 通过生化检查了 PTPRT(最常见的蛋白质酪氨酸磷酸酶改变)中的 5 个错义突变,发现它们降低了磷酸酶活性。野生型而非突变型 PTPRT 在人类癌细胞中的表达抑制了细胞生长。王等人(2004) 得出的结论是,他们的观察表明突变的酪氨酸磷酸酶是肿瘤抑制基因,调节可能适合治疗干预的细胞途径。