锌指蛋白 618; ZNF618

神经前体细胞表达,发育下调 10; NEDD10
KIAA1952

HGNC 批准的基因符号:ZNF618

细胞遗传学位置:9q32 基因组坐标(GRCh38):9:113,876,309-114,056,593(来自 NCBI)

▼ 说明

DNA 甲基化是一种表观遗传修饰,可调节基因转录、基因组印记和 X 染色体失活。 DNA 甲基化在 CpG 环境中主要以 5-甲基胞嘧啶(5mC) 形式存在。 5mC 可被氧化成多种衍生物,其中最著名的是 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)。 ZNF618 与异二聚体中的 UHRF2(615211) 相互作用,并将 UHRF2 引导至富含 5hmC 的基因组区域,其中 UHRF2 充当 5hmC 读取器(Liu et al., 2016)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2001) 克隆了 ZNF618,他们将其命名为 KIAA1952。推导的 735 个氨基酸的蛋白质具有 C2H2 型锌指结构域。 RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织中都有不同的 KAA1952 表达,其中肾脏中表达最高,其次是卵巢。整个成人大脑和所有特定的成人大脑区域检查显示 KIAA1952 表达低得多。

刘等人(2016) 指出 ZNF618 在其 N 端部分有 4 个锌指。蛋白质印迹分析在所有检查的人类细胞系中检测到 ZNF618。当转染到小鼠胚胎成纤维细胞中时,ZNF618 定位于中心周异染色质。

▼ 基因功能

通过对与表位标记的 UHRF2 相互作用的 293T 蛋白进行质谱分析,Liu 等人(2016) 鉴定出 ZNF618。相互蛋白质亲和纯化证实了 UHRF2 和 ZNF618 之间的相互作用,其化学计量比似乎为 1:1。内源性 HEK293 细胞 ZNF618 不与 UHRF1 相互作用(607990)。结构域分析表明,UHRF2 的 SRA 结构域与 ZNF618 的锌指 3 和 4 结合。 ZNF618 的锌指 1 和 2 结合中心周异染色质。 UHRF2 在染色质上的分布比 ZNF618 更广泛;然而,在 UHRF2 与 ZNF618 共定位的区域中,5hmC 读取计数增加,并且 UHRF2 的染色质结合部分在 ZNF618 耗尽后减少。刘等人(2016) 得出结论,与 ZNF618 的相互作用促进 UHRF2 在包含 5hmC 的基因组区域定位,其中 UHRF2 可以充当 5hmC 阅读器。

▼ 测绘

Hartz(2016) 根据 ZNF618 序列(GenBank AB075832) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZNF618 基因对应到染色体 9q32。