NOP2/SUN RNA 甲基转移酶家族,成员 6; NSUN6
NOL1/NOP2/Sun DOMAIN 家族,成员 6
HGNC 批准的基因符号:NSUN6
细胞遗传学位置:10p12.31 基因组坐标(GRCh38):10:18,545,561-18,659,327(来自 NCBI)
▼ 说明
细胞 RNA 的化学修饰会影响其生物发生、结构和功能。 NOL1/NOP2/SUN 结构域(NSUN) 酶,例如 NSUN6,催化 RNA 中 5-甲基胞嘧啶(m5C) 的形成。 NSUN6 是一种 tRNA 甲基转移酶(MTase),可在 C72 位甲基化 tRNA-cys 和 tRNA-thr(参见 189913)(Haag 等人,2015)。
▼ 克隆与表达
Chi 和 Delgado-Olguin(2013) 利用原位杂交发现 Nsun6 在胚胎第 7.5 天(E7.5) 的胚胎和胚胎外小鼠组织中广泛表达。在 E10.5 时,NSUN6 的组成型表达维持在中等水平,大脑、颅面、心脏和四肢结构的发育丰富。
哈格等人(2015) 指出人类 NSUN6 在其 N 端一半包含 PUA RNA 结合结构域,在其 C 端一半包含 MTase 结构域。分级分离的 HEK293 细胞的蛋白质印迹分析表明,带有 FLAG 标签的 NSUN6 仅定位于细胞质。转染的 HEK293 细胞的荧光显微镜显示,大部分 GFP 标记的 NSUN6 定位于高尔基体和中心粒周围基质(PCM)。
▼ 基因功能
Haag 等人在转染的 HEK293 细胞中使用紫外线(UV) 和 5-氮杂胞苷交联和 cDNA(CRAC) 分析(2015) 证明,FLAG 标记的 NSUN6 主要与 tRNA 交联和共纯化,在体内富集 tRNA-cys 和 tRNA-thr。 UV 交联和蛋白质下拉实验证实了 NSUN6 和这些 tRNA 之间的相互作用。体外甲基化测定表明,重组 NSUN6 可以甲基化来自用针对 NSUN6 的小干扰 RNA(siRNA) 处理的 HeLa 细胞的 RNA,但不能甲基化来自非目标 siRNA 处理的细胞的 RNA。重组 NSUN6 还能够甲基化体外转录的 tRNA-cys 和 tRNA-thr。突变分析表明 NSUN6 需要完整的 MTase 结构域才能甲基化其底物。 tRNA-cys 和 tRNA-thr 突变体的体外甲基化测定将位置 C72 确定为 NSUN6 靶位点。 NSUN6 对 tRNA-thr 的甲基化需要 3 素 CCA 序列。 Haag 等人根据其在高尔基体和 PCM 中的定位,(2015) 提出 NSUN6 在生物发生后期修饰 tRNA。
▼ 测绘
Gross(2016) 根据 NSUN6 序列(GenBank BC035778) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NSUN6 基因对应到染色体 10p12.31。