远上游元件结合蛋白 1; FUBP1
远上游元素结合蛋白; FUBP
熔丝结合蛋白; FBP
HGNC 批准的基因符号:FUBP1
细胞遗传学位置:1p31.1 基因组坐标(GRCh38):1:77,944,055-77,979,501(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
人类 MYC(190080) 原癌基因的远上游元件(FUSE) 可刺激未分化细胞中的表达。邓肯等人(1994) 纯化了一种 70-kD FUSE 结合蛋白(FBP),该蛋白存在于未分化但未分化的细胞中。 FBP 在体外表现出对 FUSE 位点非编码链的 DNA 结合特异性。通过使用基于部分 FBP 蛋白序列的简并引物对人类细胞系 cDNA 进行 PCR,作者分离出了部分 FBP cDNA。他们从几个文库中回收了额外的 cDNA,并用它们组装了全长 FBP cDNA 序列。预测的 644 个氨基酸蛋白质的中心区域包含 4 个重复单元拷贝。突变蛋白构建体的体外结合测定表明,第三和第四个拷贝构成了最小的单链 DNA 结合结构域。 Duncan 等人使用高锰酸钾探测体内 DNA 构象(1994) 确定基因组 DNA 的敏感性模式与 FBP 与 FUSE 非编码链的结合一致,从而取代了编码链。 FBP 在人白血病细胞中的表达以 FUSE 依赖性方式刺激 MYC 启动子的活性。 Northern 印迹分析显示,2.6 kb FBP mRNA 的表达在分化时下降,表明 FUSE 结合活性可能受到转录调节。此外,通过对 FBP cDNA 的序列分析,作者发现证据表明 FBP 活性也可能受到选择性剪接、翻译效率和翻译后修饰的调节。
▼ 基因功能
转录因子 IIH(TFIIH) 解旋酶亚基 XPB(133510) 或 XPD(278730) 的遗传突变会产生重叠的 DNA 修复和转录综合征。这些患者患癌症的高风险并不能完全用修复缺陷来解释。然而,转录缺陷很微妙,更难以评估。刘等人(2001) 表明 XPB 和 XPD 突变阻断 FBP(MYC 表达调节因子)的转录激活,并阻断 FBP 相互作用阻遏物的抑制(FIR;604819)。通过 TFIIH,FBP 促进转录直至启动子逃逸,而在启动后,FIR 使用 TFIIH 来延迟启动子逃逸。削弱 FBP 和 FIR 调节的 TFIIH 突变会影响 MYC 表达的正常调节,并对恶性肿瘤的发展产生影响。
▼ 分子遗传学
贝特戈达等人(2011) 对 7 例少突胶质细胞瘤进行了外显子测序。除其他变化外,他们发现 6 例肿瘤中 19q 染色体上的 CIC 基因(612082)(果蝇基因 capicua 的同源物)发生体细胞突变,1p 染色体上的 FUBP1 基因在 2 例肿瘤中发生体细胞突变。对另外 27 个少突胶质细胞瘤的检查发现,另外 12 个和 3 个肿瘤分别具有 CIC 和 FUBP1 突变,其中 58% 预计会导致编码蛋白的截短。贝特戈达等人(2011) 得出的结论是,他们的结果表明这些基因在少突胶质细胞的生物学和病理学中发挥着关键作用。