核 RNA 输出因子 3; NXF3
HGNC 批准的基因符号:NXF3
细胞遗传学位置:Xq22.1 基因组坐标(GRCh38):X:103,075,810-103,093,143(来自 NCBI)
mRNA 从细胞核中输出涉及多种蛋白质,包括核孔蛋白、RNA 结合蛋白、RNA 解旋酶(DDX19;605812) 和核孔复合物相关蛋白,例如 NXF1(602647) 和 RAE1(603343)。 Herold 等人通过在 EST 数据库中搜索 NXF1 同源物并通过 RT-PCR 分析(2000) 获得了编码 NXF2(300315)、NXF3、NXF4(300318) 和 NXF5(300319) 的 cDNA。推导的 531 个氨基酸的 NXF3 蛋白具有 NXF1 的保守结构域结构,包括一个非规范的 RNP 型 RNA 结合结构域(RBD)、4 个富含亮氨酸的重复序列(LRR)、一个核转运因子 2(NTF2; 605813)允许与 NTF2 相关输出蛋白 1(NXT1;605811) 异二聚化的类似结构域,以及介导与核孔蛋白相互作用并在 NXF3 中被截短的泛素相关结构域。结合分析表明 NXF1、NXF2 和 NXF3 与 E1BAP5(605800) 以及 NXT1 和 NXT2(300320) 相互作用。 NXF1 和 NXF2 的 RBD(而非 NXF3 的 RBD)被发现与 RNA 结合。然而,只有 NXF1 可以促进由猿猴 D 型逆转录病毒的组成型转运元件介导的 RNA 输出。 NXF1 和 NXF2(但 NXF3 除外)通过其 C 端 NWD 环可以与核孔蛋白 CAN(NUP214;114350)、NUP153(603948) 和 NUP62(605815) 结合。只有 NXF1 可以结合 NUP98(601021)。荧光显微镜显示 NXF3 在核质中表达,但不包括在核仁和核膜中;一部分 NXF3 也在细胞质中表达。 CAT 报告基因和蛋白质印迹分析表明,NXF1 或 NXF2(而非 NXF3)与 NXT1 或 NXT2 的共表达激活了 CAT 表达。赫罗德等人(2000) 认为 NXF3 不能刺激 RNA 输出,因为删除了部分 LRR 区域。
杨等人(2001) 证明 NXF3,一种与 TAP(602647) 相关的人类 RNA 结合蛋白,缺乏直接与核孔复合物成分相互作用的 C 端结构域,但它保留了输出束缚 RNA 转录本和穿梭的能力细胞核和细胞质之间。 NXF3 包含 CRM1(导出蛋白;602559)依赖性核输出信号,可顺式补偿核孔靶向结构域的损失。因此,NXF3 依赖性 RNA 输出被 CRM1 特异性抑制剂阻断,但不影响 TAP 功能。因此,虽然相关的 TAP 和 NXF3 蛋白都能够介导核 RNA 输出,但它们是通过不相关的输出途径实现的。
通过基因组序列分析,Herold 等人(2000) 确定 NXF3 基因至少包含 21 个外显子。
Herold 等人使用基因组序列分析(2000) 将 NXF3 基因对应到 Xq21.3-q22.3。