小卡哈尔体特异性 RNA 5; SCARNA5
snoRNA, U87
HGNC 批准的基因符号:SCARNA5
细胞遗传学位置:2q37.1 基因组坐标(GRCh38):2:233,275,726-233,276,003(来自 NCBI)
小核仁 RNA(snoRNA),如 SCARNA5,充当指导 RNA 转录后修饰的向导。含有 C/D 框的 SnoRNA 与原纤维蛋白(FBL; 134795) 关联,并且剪接体小核 RNA(snRNA) 的直接 2-prime-O-核糖甲基化,而含有 H/ACA 框的 SnoRNA 与 GAR1 关联(NOLA1; 606468) snRNA 的直接假尿苷化。 SCARNA5 包含 C/D 和 H/ACA 框,预计可指导 snRNA 的 2-prime-O-甲基化和假尿苷化(Darzacq 等,2002)。
Darzacq 等人通过对 HeLa 细胞中与纤维蛋白免疫沉淀的 RNA 进行测序,(2002) 鉴定了 SCARRNA5,他们将其命名为 U87。 277个核苷酸的RNA含有保守的5-prime box C和3-prime box D基序,可以形成长茎结构和可以折叠成box H/ACA snoRNA共有发夹-铰链-发夹-尾部的中间区域。在 HeLa 和 COS-7 细胞中过表达后,荧光原位杂交和细胞分级分离显示 U87 与 Cajal 体标记物 coilin(COIL; 600272) 共定位。
Darzacq 等人通过 HeLa 细胞的免疫沉淀分析(2002) 发现人类 U87 与 GAR1 和原纤维蛋白相互作用。
达尔扎克等人(2002) 确定 SCARNA5 起源于 ATG16L1 基因(610767) 的内含子 9,该基因对应到染色体 2q37.1(Zheng 等人,2004)。