长基因间非编码 RNA COX2

lincRNA COX2
长非编码 RNA COX2
lncRNA COX2

细胞遗传学位置：1q25.2-q25.3 基因组坐标（GRCh38）：1:176,100,001-185,800,000

▼ 说明

长基因间非编码 RNA lincRNA-COX2 是炎症反应的关键调节因子，介导不同类别免疫基因的激活和抑制（Carpenter et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

卡彭特等人（2013） 发现 lincRNA-COX2 是当用合成细菌脂肽刺激小鼠骨髓源性巨噬细胞时诱导程度最高的 lncRNA 之一。 lincRNA-COX2 位于 COX2 基因附近，有 3 个转录本。变体 1 是最丰富的转录本，包含所有剪接变体共有的外显子 1 和 4。变体 2 包含全部 4 个外显子，变体 3 包含外显子 1、2 和 4。李斯特菌感染细胞导致 lincRNA-COX2 水平升高，并且依赖于 Tlr 接头蛋白 MyD88（602170） 和转录因子 NF-kappa- B（参见164011）信令。卡彭特等人（2013） 发现 lincRNA-COX2 不太可能编码蛋白质产物。在未刺激的细胞上，lincRNA-COX2 的 shRNA 沉默使 787 个基因的表达增加了 3 倍或更多。这些基因大多数与免疫反应相关，包括趋化因子（参见 155730）、趋化因子受体（参见 601470）和干扰素（参见 147570）刺激的基因。在用合成细菌脂肽刺激的相同细胞上，linc-COX2 的沉默导致 713 个基因的表达减弱 3 倍或更多。其中包括 TLR1（601194）、IL6（147620） 和 IL23A（605580） 等基因。 lincRNA-COX2 在巨噬细胞的核和胞质区室中均可见，并且被发现在核和胞质部分中均结合 hnRNPAB（602688） 和 hnRNPA2B1（600124）。通过蛋白质印迹分析证实结合。