小核核糖核蛋白 (U4/U6.U5),SNU13 同源物; SNU13
非组蛋白染色体蛋白 2,酿酒酵母,同源样 1; NHP2L1
NHP2 样蛋白 1
U4/U6-15.5K 蛋白质
15.5K
HGNC 批准的基因符号:SNU13
细胞遗传学位置:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:41,673,933-41,690,480(来自 NCBI)
▼ 说明
NHP2L1 是剪接体复合物的组成部分。它在 U4 和 U6(180692) RNA 附着后被招募到内含子,并且是随后招募 PRP31(606419) 和激活剪接体复合物所必需的(Liu 等人总结,2007)。
▼ 克隆与表达
在对胎儿脑 cDNA 文库中的 cDNA 克隆进行测序的过程中,Saito 等人(1996) 从酿酒酵母中分离出编码与 NHP2 高度同源的蛋白质的基因(Kolodrubetz 和 Burgum, 1991)。 NHP2 是一种位于细胞核中的高迁移率基团(HMG) 样蛋白,尽管它与一些核糖体蛋白显示出较弱的同源性。斋藤等人(1996) 确定推导的 NHP2L1 蛋白含有 128 个氨基酸。 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 1.6 和 0.7 的转录本。
▼ 生化特征
晶体结构
刘等人(2007) 报道了 15.5K、U4 5-prime 茎环结构和 PRPF31 片段复合物的晶体结构,分辨率为 2.6 埃。 PRP31 片段包括 NOP 结构域和卷曲螺旋区域。 15.5K 稳定了用于添加 PRP31 的 RNA K 转角区域,并且 PRP31 的 NOP 结构域与 15.5K 和 RNA 相互作用。添加 PRPF31 不会影响核心 15.5K-RNA 复合物的构象。
▼ 测绘
斋藤等人(1996)通过荧光原位杂交将NHP2L1基因定位于染色体12q24.3。然而,Gross(2011) 根据 NHP2L1 序列(GenBank BC005358) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 NHP2L1 基因对应到染色体 22q13.2。