剪接因子 3B,亚基 3; SF3B3
SF3B,130-KD 亚基; SF3B130
剪接体相关蛋白,130-KD; SAP130
HGNC 批准的基因符号:SF3B3
细胞遗传学位置:16q22.1 基因组坐标(GRCh38):16:70,523,816-70,577,668(来自 NCBI)
▼ 说明
SF3B3 基因编码 U2 snRNP 的一个组件,可以通过与 MINCLE(CLEC4E; 609962) 结合来激活免疫系统(Metselaar 等人的总结,2021)。
▼ 克隆与表达
Das等人通过剪接体复合物A的SDS-PAGE分级分离、微肽序列分析、数据库搜索和cDNA文库筛选(1999) 分离出编码 SF3B3 的 cDNA,他们将其称为 SAP130。 SF3B3 编码预测的 1,217 个氨基酸的蛋白质,与 Nomura 等人鉴定的 KIAA0017 cDNA 编码的蛋白质相同(1994)。蛋白质印迹分析在核提取物、体外翻译的 cDNA 和剪接体复合物中检测到 130 kD 的蛋白质。免疫共沉淀和蛋白质印迹分析确定 SF3B3 和其他 SF3B 蛋白是 U2 snRNP 的组成部分,并且 SF3B1、SF3B2(605591) 和 SF3B3 存在于孤立于 SF3A 和 U2 snRNA 的特定蛋白复合物中。达斯等人(1999) 观察到 SF3B3 和 SF3B1 之间的相互作用比 SF3B3 和 SF3B2 之间的相互作用更紧密。
有关 SF3B 蛋白的背景信息,请参见 SF3B1(605590)。
▼ 测绘
Stumpf(2021) 根据 SF3B3 序列(GenBank BC068974) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SF3B3 基因对应到染色体 16q22.1。
▼ 基因功能
塞弗特等人(2016) 报道,坏死体的主要成分受体相互作用蛋白 RIP1(603453) 和 RIP3(605817) 在胰腺导管腺癌(PDA) 中高度表达,并且化疗药物吉西他滨进一步上调。细胞质 SF3BP 是组蛋白脱乙酰酶复合物的一个亚基,在 PDA 中以 RIP1/RIP3 依赖性方式表达,其同源受体 MINCLE(609962) 在肿瘤浸润骨髓细胞中表达上调。 SF3BP 连接 MINCLE 促进肿瘤发生,而 MINCLE 缺失可防止肿瘤发生,并对 RIP3 缺失诱导的肿瘤微环境的免疫原性重编程进行表型复制。细胞耗竭表明,虽然抑制性巨噬细胞促进 PDA 中的肿瘤发生,但当 RIP3 或 MINCLE 被删除时,它们就会失去免疫抑制作用。塞弗特等人(2016) 得出的结论是,他们的工作描述了坏死性凋亡诱导的 CXCL1 和 MINCLE 信号传导的并行网络,这些信号促进巨噬细胞诱导的适应性免疫抑制,从而促进 PDA 进展(在 Seifert 等人(2016) 的文章中,SF3B3 被错误地仅引用为“SAP30”。Metselaar 等人(2021) 指出,此错误导致文献中 SF3B3 和 SAP30 之间出现混淆( 609697),2016 年文章的作者已发布勘误表。)