剪接因子 3B，亚基 2； SF3B2

SF3B，145-KD 亚基； SF3B145
剪接体相关蛋白，145-KD； SAP145

HGNC 批准的基因符号：SF3B2

细胞遗传学位置：11q13.1 基因组坐标（GRCh38）：11:66,052,364-66,069,308（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Gozani 等人通过剪接体复合物 A 的 SDS-PAGE 分级分离、微肽序列分析、使用简并引物的 PCR 以及 cDNA 文库筛选（1996）分离出编码 SF3B2 的 cDNA，他们将其称为 SAP145。序列分析预测，这种由 872 个氨基酸组成的高亲水性蛋白质具有富含脯氨酸的 N 末端、C 末端富含谷氨酸的片段，并且缺乏 RNA 结合基序。 SDS-PAGE 分析表明，预测分子量为 98 kD 的 SF3B2 根据 SDS 浓度异常表达为 120 或 145 kD 蛋白质，并且 SF3B2 在 20 个核苷酸处与前体 mRNA 交联区域，锚定点，分支点的上游。戈扎尼等人（1996）还表明 SF3B2 与 SF3B4 相互作用（605593）。

有关 SF3B 蛋白的背景信息，请参见 SF3B1（605590）。

▼ 测绘

Stumpf（2022）根据 SF3B2 序列（GenBank BC007610）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 SF3B2 基因对应到染色体 11q13.1。

▼ 分子遗传学

在一个大型多代澳大利亚谱系中，颅面微小症对应到染色体 11q12-q13（CFM；164210），Timberlake 等人（2021）鉴定了 SF3B2 基因（M1?; 605591.0001）中起始丢失变化的杂合性，该基因与家族中的疾病完全分离。对 146 个家庭的跨国队列（其中 1 个或多个个体患有 CFM）进行的全外显子组或全基因组测序显示 3 个家庭的 SF3B2 基因存在杂合截短突变（参见例如 605591.0002 和 605591.0003）。使用 GeneMatcher 平台，来自 3 个家族（家族 4、5 和 6）的另外 5 名患者被鉴定出具有 SF3B2 杂合截短突变（参见例如 605591.0004）。这些突变在每个家族中随疾病而分离，并且在 gnomAD 数据库中未发现。

▼ 动物模型

半面短小症（HFM；参见 164210）的先天性异常表明颅神经嵴细胞的形成受到干扰，这些细胞通常迁移到第一和第二咽弓。汀布莱克等人（2021）在非洲爪蟾胚胎中对 sf3b2 进行靶向吗啉敲除，并观察到神经胚阶段神经嵴特异性基因 sox10（602229）的剂量依赖性减少。其他神经嵴基因，包括 tfap2e（614428）和 snai2（602150）的表达也类似地减少，并且 sox2（184429）表达域扩大，与神经板边界的丢失一致。 sf3b2 变形体在尾芽阶段表现出神经嵴流的背腹扩张显着减少。 45 阶段的非洲爪蟾蝌蚪表现出明显的颅面缺陷，影响了注射侧头部的整体尺寸。阿尔新蓝染色显示 sf3b2 变形蝌蚪中神经嵴来源的软骨发育不全或不存在。作者得出结论，神经嵴祖细胞的耗竭导致了 HFM 的发病机制。

▼ 等位基因变异体（4 个选定示例）：

.0001 颅面显微术
SF3B2、MET1？

在澳大利亚一个大型血统（亲缘 7）的 3 代以上的 11 名受影响个体中，颅面微小症对应到染色体 11q12-q13（CFM；164210），最初由 Singer 等人描述（1994），汀布莱克等人（2021）鉴定了 SF3B2 基因中 c.1A-T 颠换（c.1A-T, NM_006842.2）的杂合性，消除了翻译起始位点。该突变与家族中的疾病完全分离，并且在 gnomAD 数据库中未发现。

.0002 颅面显微术
SF3B2，1-BP DUP，2480C

Timberlake 等人在一名患有颅面微小症（CFM; 164210）的 14 岁男孩（亲属 2）中（2021）鉴定了 1 bp 重复（c.2480dupC, NM_006842.2）的杂合性，导致预计会导致过早终止密码子（Ala827ArgfsTer5）的移码。他的父亲有一个左耳标，也是重复的杂合子。他的母亲有双侧耳标，但在 gnomAD 数据库中并未发现该变异。

.0003 颅面显微术
SF3B2，1-BP DEL，1780-2A

Timberlake 等人在一名患有颅面短小症（CFM; 164210）的 10 岁亚裔印度男孩（亲属 3）中进行了研究（2021）鉴定了 SF3B2 基因内含子 15 中从头剪接位点缺失（c.1780-2delA, NM_006842.2）的杂合性。在他未受影响的父母或 gnomAD 数据库中均未发现该突变。

.0004 颅面显微术
SF3B2、ARG638TER

Timberlake 等人在患有颅面微小症（CFM; 164210）的姐妹和兄弟（亲属 5）中（2021）鉴定了 SF3B2 基因中 c.1912C-T 转变（c.1912C-T, NM_006842.2）的杂合性，导致 arg638 到 ter（R638X）取代。在其未受影响的父母中未发现该突变，这与性腺嵌合一致，并且不存在于 gnomAD 数据库中。