癌症/睾丸抗原家族 47，成员 A11； CT47A11

CT47.11
LOC255313

HGNC 批准基因符号：CT47A11

细胞遗传学位置：Xq24 基因组坐标（GRCh38）：X:120,933,840-120,937,158（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

陈等人（2006） 鉴定出 LOC255313，它编码 288 个氨基酸的蛋白质，是染色体 Xq24 上 CT47 基因 13 个拷贝之一。拷贝从最端粒拷贝 CT47.1（CT47A1; 300780） 到最着丝粒拷贝 CT47.13（CT47B1; 300790） 进行编号。在 13 个 CT47 拷贝中，11 个是精确或接近精确的，具有超过 99% 的核苷酸同一性，2 个（CT47.6、300785 和 CT47.13）不太精确，但仍然具有超过 95% 的核苷酸同一性。定量RT-PCR检测到CT47在睾丸中强表达，在胎盘中低表达，在脑中极低表达。数据库分析在潘穴居动物 X 染色体上发现了重复的 CT47 同源物，但在非灵长类物种中没有发现 CT47 同源物，表明最近发生了基因重复事件。

使用 Strausberg 等人提供的 CT47A11 登录号（2002）（GenBank BC029540），Hartz（2009） 鉴定了 CT47 基因的 12 个拷贝。其中，9 个具有 100% 的核苷酸同一性，3 个具有超过 90.0% 的核苷酸同一性。全部含有 3 个外显子。

▼ 基因结构

陈等人（2006） 确定 LOC255313 基因跨度为 3.3 kb，包含 3 个外显子，最后一个是非编码的。

▼ 测绘

通过序列分析，Chen 等人（2006） 将 CT47 基因的 13 个串联重复（包括 LOC255313）定位到染色体 Xq24 负链上的 60 kb 片段。

Hartz（2009） 根据包含 CT47A11（GenBank AB097024） 的序列与基因组序列（build 36.1） 的比对，将 CT47 基因的重复对应到染色体 Xq24。