SR 相关 C 端结构域相关因子 11； SCAF11

SR 相关 CTD 相关因素 11
剪接因子，富含精氨酸/丝氨酸，2-相互作用蛋白； SFRS2IP
SFRS2 相互作用蛋白
SC35 相互作用蛋白 1； SIP1
CTD 相关 SR 蛋白 11； CASP11
SR 相关蛋白，129-KD； SRRP129

HGNC 批准的基因符号：SCAF11

细胞遗传学位置：12q12 基因组坐标（GRCh38）：12:45,919,131-45,992,059（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

与其他 SR 蛋白一样，SC35（600813） 剪接因子包含富含精氨酸/丝氨酸（RS） 结构域和 RNA 结合基序。使用 SC35 作为诱饵的酵母 2-杂交筛选，Zhang 和 Wu（1998） 分离了编码 SIP1（一种新型 SC35 相互作用蛋白）的 HeLa 细胞部分 cDNA。他们使用部分 cDNA 筛选 HeLa 细胞文库，并回收了与整个 SIP1 编码区相对应的 cDNA。预测的 1,403 个氨基酸蛋白包含一个与几种 SR 蛋白中发现的类似的 RS 结构域，以及一个与白杏果蝇剪接调节抑制因子（SWAP; 601945） 具有弱相似性的区域。此外，SIP1 的 C 端区域包含 RNA 聚合酶 II C 端结构域（CTD） 结合基序。尽管 SIP1 的预测分子量为 158 kD，但通过 SDS-PAGE 检测，该蛋白的迁移速度为 210 kD。作者认为这种差异可能是由于磷酸化等翻译后修饰造成的，已知磷酸化会导致 SDS-PAGE 中几种含有 RS 结构域的蛋白质的异常迁移。

Tanner 等人通过进行酵母 2 杂交测定来鉴定与 CTD 相互作用的蛋白质（1997） 分离了编码 SIP1 的部分 cDNA，他们将其称为 CTD 相关 SR 蛋白 11（CASP11） 或 129 kD SR 相关蛋白（SRrp129）。 Northern 印迹分析检测到所有测试组织中大约 6 kb SRrp129 mRNA 的表达。

▼ 基因功能

使用酵母 2 杂交测定和免疫沉淀研究，Zhang 和 Wu（1998） 表明 SIP1 与几种 SR 蛋白以及 U2AF65（191318） 和 U1-70K（180740） 相互作用，这些蛋白与 3-prime 和 5-prime 相关。 -分别是主要剪接位点。针对 SIP1 的抗体消除了 HeLa 细胞核提取物的剪接活性。在 SIP1 耗尽的核提取物中，前剪接体复合物 A 和 B 的形成是有缺陷的。 Zhang 和 Wu（1998） 得出结论，SIP1 是前 mRNA 剪接所需的一种新型 RS 结构域蛋白。

▼ 测绘

通过包含在映射克隆中，Tanner 等人（1997） 将 SRrp129 基因定位到染色体 21q22.3。然而，Gross（2011） 根据 SCAF11 序列（GenBank BC141552） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 SCAF11 基因对应到染色体 12q12。