BEN 域包含蛋白 3; BEND3

KIAA1553

HGNC 批准的基因符号：BEND3

细胞遗传学位置：6q21 基因组坐标（GRCh38）：6:107,065,182-107,115,515（来自 NCBI）

▼ 说明

BEND3 定位于异染色质并充当转录抑制子（Sathyan 等人，2011）。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序（2000） 获得了部分 BEND3 克隆，他们将其命名为 KIAA1553。 RT-PCR ELISA 在除骨骼肌之外的所有成人和胎儿组织以及所有成人大脑区域中检测到 BEND3 表达。

萨蒂安等人（2011） 报道全长 828 个氨基酸的 BEND3 蛋白具有 4 个 BEN 结构域、3 个丝氨酸磷酸化位点和 2 个赖氨酸苏酰化位点（参见 SUMO1, 601912）。每个 BEN 结构域均由带有 4 个保守螺旋的全 α 折叠组成。定量RT-PCR检测到BEND3在人脾脏中高表达，在肾脏、肝脏和卵巢中表达较低，在心脏中表达最低。荧光标记的 BEND3 在转染的小鼠和人类细胞系中以点状核分布表达，与异染色质共定位。数据库分析揭示了几种脊椎动物物种中 BEND3 的直系同源物。

▼ 基因功能

Sathyan 等人通过在小鼠 NIH3T3 细胞中表达截短形式的人 BEND3（2011） 发现 BEN 结构域 4 对于 BEND3 定位到异染色质是必要且充分的。 BEN 结构域 4 也定位于转染的人 U2OS 细胞中的人工异染色位点。实验诱导的位点去浓缩伴随着荧光标记的 BEND3 的丢失。 BEND3 抑制报告基因的表达，并且 BEND3 在 lys20 和 lys512 处的苏酰化是基因抑制所必需的。 U2OS 细胞中 BEND3 的过度表达导致染色质过早浓缩、广泛异染色质化、细胞周期停滞在早期 S 期以及细胞死亡。免疫沉淀分析显示，BEND3 与 HDAC2（605164）、HDAC3（605166） 和 SALL4（607343） 相互作用，表明 BEND3 是 SALL4 转录阻遏蛋白的一个组成部分。

Shiheido 和 Shimizu（2015） 使用缺失突变体和定点诱变发现，BEND3 N 末端附近的 KRK 基序，而不是其他 3 个预测的核定位信号，对于 BEND3 核定位至关重要。

张等人（2022） 报道，BEND3 是一种富含调节元件的 CpG 岛结合蛋白。 BEND3 与其靶 DNA 复合的共晶结构揭示了其 DNA 甲基化敏感结合特性的结构基础。 Bend3缺失的小鼠胚胎在原肠胚形成前阶段死亡，Bend3缺失的胚胎干细胞在分化方面表现出严重的缺陷，在此期间数百个含CpG岛的二价基因被过早激活。张等人（2022） 发现 BEND3 是多梳抑制复合物 2（PRC2；参见 605984）在被 BEND3 高度占据的二价基因处稳定结合所必需的，这表明 BEND3 在维持二价 H2K27me3 的高水平方面具有重要作用。胚胎干细胞中的基因。

▼ 测绘

Nagase 等人通过对人类-啮齿动物杂交组进行 PCR 检测。 Sathyan 等（2000） 将 BEND3 基因对应到 6 号染色体（2011） 报道 BEND3 基因定位于染色体 6q21。