TATA 框结合蛋白相关因子 1 样; TAF1L
TAF1 RNA 聚合酶 II 样
HGNC 批准的基因符号:TAF1L
细胞遗传学位置:9p21.1 基因组坐标(GRCh38):9:32,629,454-32,635,669(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Wang 和 Page(2002) 描述了一种常染色体人类基因 TAF1L,它与 TAFII250(601787) 同源,并且在睾丸中特异性表达,显然是在生殖细胞中表达。作者推测,在雄性减数分裂期间,蛋白质编码基因的转录可能依赖 TAF1L 作为 TAFII250 的功能替代品。
Wang 和 Page(2002) 以电子方式搜索了人类基因组中与 TAFII250 的同源物,并鉴定了 9 号染色体上的单个基因座。由于该基因似乎不包含内含子,作者从人类睾丸 cDNA 文库中分离了克隆,对它们进行了测序,并进行了电子分析。组装全长 cDNA 序列。这种含有 1,826 个残基的蛋白质与 TAFII250 具有 95% 的氨基酸同一性。
▼ 基因功能
TFIID 是一种 DNA 结合蛋白复合物,是真核细胞中许多(如果不是全部)蛋白质编码基因的 RNA 聚合酶 II 介导的转录所需的(参见 POLR2A,180660)。与 TAFII250 一样,人 TAF1L 蛋白可以直接与 TATA 结合蛋白(TFIID 的重要组成部分)结合。用人 TAF1L 转染可挽救 TAFII250 中仓鼠细胞系突变体的温度敏感性致死性(Hayashida 等,1994)。由于 TAF1L 可以在功能上替代 TAFII250,Wang 和 Page(2002) 假设在雄性减数分裂期间,常染色体可能提供通常由体细胞中的 X 染色体提供的多种细胞功能。
▼ 生化特征
晶体结构
莫里尼尔等人(2009) 发现 Brdt(人类 TAF1 的小鼠同源物)的单个溴结构域(BD1) 负责选择性识别带有 2 个或多个乙酰化标记的组蛋白 H4 尾部。与二乙酰化 H4 尾结合的 BD1 晶体结构显示了 2 个乙酰基赖氨酸残基如何与 1 个结合袋相互作用。基于结构的诱变降低了 BD1 对脱乙酰化尾部的选择性,破坏了体内 Brdt 与乙酰化染色质的关联。结构分析表明其他染色质相关蛋白可能具有类似的配体识别模式,包括酵母 Bdf1、人 TAF1 和人 CBP/p300(600140/602700)。莫里尼尔等人(2009) 得出的结论是,他们的发现描述了一种组蛋白修饰组合读出的新机制,其中单个效应器模块将组蛋白尾部上的 2 个标记作为复合结合表位。
▼ 基因结构
Wang 和 Page(2002) 确定 TAF1L 的长度为 6.5 kb。 TAF1L 缺乏内含子,显然是由灵长类动物进化过程中经过加工的 TAFII250 mRNA 的逆位产生的。
▼ 测绘
Wang 和 Page(2002) 以电子方式搜索人类基因组中 TAFII250 的同源物,并鉴定了 9 号染色体上的单个基因座。
赫兹菲尔德等人(2007) 指出 TAF1L 基因定位于染色体 9p21.1。