黑色素瘤抗原,A 族,6; MAGEA6

MAGE6

HGNC 批准的基因符号:MAGEA6

细胞遗传学位置:Xq28 基因组坐标(GRCh38):X:152,766,136-152,769,689(来自 NCBI)

▼ 正文

MAGE 家族的基因指导肿瘤抗原的表达,这些抗原在人类黑色素瘤上被自体溶细胞性 T 淋巴细胞识别。家族 A(参见 300016)聚集在 Xq28,家族 B 聚集在 Xp21.3(参见 300097)。

▼ 克隆与表达

德普兰等人(1994) 鉴定了 12 个 A 家族 MAGE 基因。 MAGE6 cDNA 从黑色素瘤细胞 cDNA 文库中克隆。该基因编码 314 个氨基酸的多肽,与 MAGE3(300174) 99% 相同。 RT-PCR显示MAGE6在多种癌细胞系中表达,但在正常组织中仅在睾丸中表达。

▼ 基因结构

德普兰等人(1994)确定MAGEA6基因包含3个外显子,最后一个外显子包含整个编码序列。

▼ 测绘

德普兰等人(1994) 使用人类/啮齿动物细胞杂交将 MAGE 家族 A 簇对应到 Xq26-qter。罗格纳等人(1995) 完善了 MAGE 家族 A 簇到 Xq28 的映射。 12 个基因在 3.5 Mb 内排列成 3 个簇。

有关 X 染色体上编码具有 MAGE 结构域的蛋白质以及其他癌症睾丸抗原基因的基因的高频率的讨论,请参见 300016(Ross 等,2005)。

▼ 分子遗传学

胰腺癌的体细胞突变

比安金等人(2012) 进行了外显子组测序和拷贝数分析,以确定前瞻性临床队列中的基因组畸变,该队列由 142 名早期(I 期和 II 期)散发性胰腺导管腺癌患者组成。对 99 个信息丰富的肿瘤的详细分析发现了显着的异质性,其中包括 2,016 个非沉默突变和 1,628 个拷贝数变异。比安金等人(2012) 定义了 16 个显着突变的基因,重申了已知的突变并发现了新的突变基因,包括参与染色质修饰的其他基因(EPC1, 610999 和 ARID2, 609539)、DNA 损伤修复(ATM;607585)和其他机制(ZIM2(参见601483);MAP2K4,601335;NALCN,611549;SLC16A4,603878;和 MAGEA6)。与体外功能数据和动物模型的综合分析为这些遗传畸变在致癌作用中的潜在作用提供了支持证据。对反复突变基因的基于通路的分析概括了胰腺导管腺癌核心信号通路中的聚类,并在每个通路中鉴定了新的突变基因。比安金等人(2012) 还发现了传统上被描述为轴突引导胚胎调节因子的基因中频繁且多样的体细胞畸变,特别是 SLIT/ROBO(见 603742)信号传导,这在小鼠睡美人转座子介导的胰腺癌体细胞突变模型中也很明显,提供轴突引导基因可能参与胰腺癌发生的进一步支持证据。