GABA-一种受体相关蛋白; GABARAP

HGNC 批准的基因符号：GABARAP

细胞遗传学位置：17p13.1 基因组坐标（GRCh38）：17:7,240,008-7,242,449（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

神经递质 GABA（γ-氨基丁酸）的 A 型受体（参见 137160）是介导抑制性神经传递的配体门控氯离子通道。 Wang等人通过使用GABA-A受体γ-2S亚基（GABRG2；137164）的细胞内环作为诱饵对胎儿脑cDNA文库进行酵母2-杂交筛选，然后筛选成人脑cDNA文库（1999） 鉴定了编码 GABARAP 的 cDNA。序列分析预测，117 个氨基酸、13.9 kD GABARAP 蛋白包含一个碱性 N 末端和一个酸性 C 末端，总体等电点为 9.6。 Northern 印迹分析在所有测试组织（即心脏、大脑、胎盘、肺、肝脏、骨骼肌、肾脏和胰腺）中检测到 0.9-kb GABARAP 转录本。蛋白质印迹分析还检测到所有测试组织中 GABARAP 的表达，表明 GABARAP 还参与除与 GABA-A 受体相互作用以外的生物学事件。

▼ 测绘

小茂池等人（2010） 指出 GABARAP 基因对应到染色体 17p13.1。

▼ 基因功能

Wang 等人的结合分析（1999） 表明 GABARAP 的 N 端 21 个氨基酸形成与微管蛋白相互作用的 α 螺旋（参见 TUBA1；191110）。大鼠脑组织中的免疫沉淀和免疫组织化学分析证明了 GABARAP 和 GABA-A 受体的关联和共定位。

Apg8 是一种参与酵母自噬的类泛素蛋白。半胱氨酸蛋白酶 Apg4 可裂解 Apg8，产生泛素样修饰反应所需的 C 末端甘氨酸。至少有 4 个哺乳动物 Apg8 同源物：GATE16（GABARAPL2；607452）、GABARAP、MAP1LC3（参见 601242）和 APG8L（GABARAPL1；607420）。赫梅拉尔等人（2003） 发现小鼠 Atg4b（611338） 作用于这 4 个 Atg8 同源物的 C 末端，并且该反应需要 Atg4b 的活性位点半胱氨酸。尽管这些 Apg8 同源物的氨基酸序列彼此差异高达 71%，但它们对 Atg4b 的亲和力在竞争实验中大致相当。

Lee 等人使用免疫共沉淀和质谱分析（2005） 在人 2774 和 SKOV-3 卵巢肿瘤细胞裂解物中鉴定出 DDX47（615428） 是 GABARAP 的结合伴侣。酵母2-杂交分析证实了这种相互作用。单独过表达 DDX47 或 GABARAP 对 SKOV-3 细胞的增殖没有影响；然而，它们的共表达抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡。

贝伦兹等人（2010） 报道了在持续（基础）自噬条件下对人类细胞中自噬相互作用网络（AIN） 的蛋白质组学分析，揭示了 409 个候选相互作用蛋白之间的 751 个相互作用网络，子网络之间具有广泛的连接性。许多新的 AIN 成分在囊泡转移、蛋白质或脂质磷酸化以及蛋白质泛素化中发挥作用，并在因 RNA 干扰而耗尽时影响自噬体数量或通量。酵母自噬 8（ATG8） 的 6 种人类直向同源物、MAP1LC3A、MAP1LC3B（609604）、MAP1LC3C（609605）、GABARAP、GABARAPL1 和 GABARAPL2 与 67 种蛋白质相互作用，家族成员之间具有广泛的结合伙伴重叠，并且ATG8 蛋白上的保守表面频繁参与，已知该蛋白与伴侣蛋白中的 LC3 相互作用区域相互作用。贝伦兹等人（2010） 得出的结论是，他们的研究提供了哺乳动物自噬相互作用景观的全球视野，并为这一关键蛋白质稳态途径的机械分析提供了资源。

▼ 动物模型

小茂池等人（2010）发现Gabarap在发育过程中在斑马鱼的端脑、后脑和菱形体中表达，随后在其他脑区表达。 Gabarap 的敲低导致整个斑马鱼身体侏儒化，以及头部和下颌骨严重发育不全。研究结果表明，Gabarap 基因在斑马鱼的大脑发育中发挥着重要作用。