溶质载体家族 12(钠/钾/氯转运体),成员 8; SLC12A8
HGNC 批准的基因符号:SLC12A8
细胞遗传学位置:3q21.2 基因组坐标(GRCh38):3:125,082,644-125,212,748(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Hewett 等人通过连锁不平衡鉴定 3 号染色体区域与银屑病相关的 SNP(参见 PSORS5;604316),然后进行数据库分析、PCR 扩增和 5-prime RACE(2002) 鉴定了几种 SLC12A8 剪接变体。最常见的变体编码推导的 731 个氨基酸的蛋白质,其中有 2 个与 Na-K-Cl 协同转运蛋白同源的区域,Na-K-Cl 协同转运蛋白是负责电中性离子转运的膜蛋白家族。 PCR分析显示几乎无处不在的表达,在小肠、胃、睾丸、甲状腺和结肠中表达水平最高。
▼ 基因结构
休伊特等人(2002) 确定 SLC12A8 基因包含 13 个外显子,跨度超过 100 kb。
▼ 测绘
通过连锁和基因组序列分析,Hewett 等人(2002) 将 SLC12A8 基因定位到染色体 3q21。
▼ 分子遗传学
赫夫梅尔等人(2005) 研究了 210 个德国 PSORS5 三人组和一个由 375 名患者和 376 名对照组成的病例对照组,并检测了 SLC12A8 基因的 6 个 SNP 和 3 个基于连锁不平衡的单倍型的关联。 ss35527511(p = 0.0008) 和单倍型 E2(p = 0.00059) 的关联最强,并且孤立于 HLA 相关 PSORS1(177900) 风险等位基因。通过扩展单倍型分析,Huffmeier 等人(2005)证明SLC12A8中存在2个孤立的关联信号。