GAR1 核糖核蛋白; GAR1
GAR1,酿酒酵母,同源物
核仁蛋白家族 A,成员 1;NOLA1
HGNC 批准的基因符号:GAR1
细胞遗传学位置:4q25 基因组坐标(GRCh38):4:109,815,510-109,824,737(来自 NCBI)
▼ 说明
H/ACA 类小核仁 RNA(snoRNA) 指定尿苷至假尿苷转化的位点。 H和ACA基序分别位于2域发夹-铰链-发夹-尾结构的铰链和尾部。尿苷转化过程,连同间隔区的去除和核糖基团的 2-prime-O-甲基化(由 C/D 类 snoRNA 进行)是生成功能性 rRNA 所必需的(参见 Tollervey和 Kiss(1997) 了解更多信息)。 GAR1 是 H/ACA sno 核糖核蛋白(snoRNP) 和端粒酶的组成部分(参见 602322)(Dragon 等人,2000)。
▼ 克隆与表达
通过细胞分级分离和竞争测定,Dragon 等人(2000) 表明 U17 裂解 RNA(参见 603238)和端粒酶 RNA 的 3-prime 末端发夹可以与 H/ACA 类的 RNA 和 4 种蛋白质(60、29、23 和 14 kD)结合形成 RNP 。 Dragon 等人通过 EST 数据库搜索和探测 Burkitt 淋巴瘤 cDNA 文库(2000) 获得了编码 NOLA1 的 cDNA,他们根据其酵母同源物将其称为 GAR1。推导的 217 个氨基酸的 NOLA1 蛋白包含一个核心结构域,其两侧是富含甘氨酸和精氨酸(GAR) 的结构域,它们构成了序列的一半。蛋白质印迹分析显示 28 kD 蛋白质的表达,高于计算的 23 kD 质量。免疫沉淀分析表明,NOLA1 是 H/ACA snoRNP 和端粒酶的亚基,但它不是 H/ACA 蛋白组装所必需的。龙等人(2000) 提出 23-和 14-kD H/ACA 蛋白代表酵母 Nhp2(NOLA2; 606470) 和 Nop10(NOLA3; 606471) 蛋白的人类同源物。
▼ 测绘
Gross(2021) 根据 GAR1 序列(GenBank BC003413) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 GAR1 基因对应到染色体 4q25。