微小RNA 200A; MIR200A
miRNA200A
MIRN200A
HGNC 批准的基因符号:MIR200A
细胞遗传学位置:1p36.33 基因组坐标(GRCh38):1:1,167,863-1,167,952(来自 NCBI)
▼ 说明
MicroRNA(miRNA),例如 MIRN200A,是 20 至 22 核苷酸的非编码 RNA,通过与目标 mRNA 的 3 素 UTR 中的互补序列结合,在转录后水平抑制基因表达(Park 等人,2008)。
▼ 克隆与表达
帕克等人(2008)指出miR200A属于miRNA的miR200家族,根据种子序列中1个核苷酸的差异可以将其分为2个亚家族。 miR200A 和 miR141(612093) 具有 AACACUG 种子序列,而 miR200B(612091)、miR200C(612092) 和 miR429(612094) 具有 AAUACUG 种子序列。
▼ 基因功能
帕克等人(2008)评估了 60 个人类细胞系中 207 个 miRNA 的表达,发现 miR200 家族成员(包括 miR200A)的表达与上皮表型相关。这些 miRNA 的表达与上皮细胞标记物 E-钙粘蛋白(CDH1; 192090) 的表达呈正相关,与间充质细胞标记物波形蛋白(VIM; 193060) 的表达呈负相关。帕克等人(2008) 在 E-钙粘蛋白转录抑制因子 ZEB1(189909) 和 ZEB2(605802) 的 3-prime UTR 中鉴定出多个 miR200 靶序列。利用小鼠和人类ZEB1和ZEB2的3-prime UTR,他们发现内源性miR200抑制ZEB1和ZEB2的表达。增加 miR200A 和 miR200C 的水平可诱导人类癌细胞系中的间充质到上皮细胞的转变(MET),从而降低其侵袭性。相反,降低 miR200 水平会诱导上皮间质转化(EMT)。帕克等人(2008) 得出结论,miR200 家族通过靶向 ZEB1 和 ZEB2 来调节 EMT/MET,ZEB1 和 ZEB2 控制 E-钙粘蛋白的表达。
Gregory 等人使用 MDCK 犬上皮细胞系和具有间充质表型的亚克隆(2008) 孤立表明 miR200 家族,包括 miR141 和 miR205(613147) 调节 Zeb1 和 Zeb2 的表达并控制 EMT。此外,在具有间充质表型的侵袭性人乳腺癌细胞系和缺乏E-钙粘蛋白的原发性乳腺癌样本中,miR200家族和miR205的表达缺失。
通过小鼠成纤维细胞的微阵列分析,Mateescu 等人(2011) 发现氧化应激刺激 MIR200 家族成员的表达。小鼠和人类 MIR200A 和 MIR141 通过 MAPK14 转录物 3 素 UTR 中的靶位点下调 MAPK14(600289) 的表达,从而特异性改变 MAP 激酶对 H2O2 的反应。 MIR200A或MIR141的过度表达导致几种小鼠和人类细胞系中MAPK14下调,并且过度表达MIR200A或MIR141的细胞在移植到裸鼠上时会促进更大的卵巢细胞肿瘤。在 60 种不同的人类癌细胞系中,MAPK14 的表达与 MIR200A 和 MIR141 的表达成反比。在高级别人类卵巢腺癌中,MIR200A 积累与低浓度的 MAPK14 和氧化应激特征相关。微阵列分析显示,MIR200A 表达与 MET 相关基因呈负相关,MIR200A 表达与氧化应激相关基因呈正相关。马泰斯库等人(2011) 得出结论,MIR141 和 MIR200A 通过下调 MAPK14 来控制氧化应激反应。
转录因子 NRF2(NFE2L2; 600492) 的表达在很大程度上通过其与 KEAP1(606016) 的关联进行调节,KEAP1(606016) 可促进细胞质 NRF2 降解。伊德斯等人(2011) 发现 MIR200A 与 KEAP1 转录本的 3-prime UTR 结合,导致 mRNA 降解。乳腺癌细胞中 MIR200A 的表观遗传沉默导致 KEAP1 失调、NRF2 转录活性抑制以及 NRF2 解毒靶基因 NQO1(125860) 的表达减少。 MIR200A 在人乳腺癌细胞中过度表达或用组蛋白脱乙酰酶抑制剂治疗小鼠乳腺癌模型可增强 MIR200A 依赖性 KEAP1 下调并恢复 NRF2 表达。
夏普等人(2014) 发现 Mir200a 和 Pitx2(601542) 的共转染(但两者单独构建)导致小鼠 LS-8 口腔上皮细胞和小鼠 MDPC-23 成牙本质细胞间充质细胞转化为表达 E-钙粘蛋白(CDH1) 的分化牙上皮细胞;192090)和牙釉蛋白(参见 AMELX,300391)和下调的 β-连环蛋白(CTNNB1;116806)和其他间充质标记物。
▼ 测绘
帕克等人(2008) 指出 miR200 家族成员 MIRN200A、MIRN200B 和 MIRN429 聚集在 1 号染色体上,而 MIRN200C 和 MIRN141 聚集在 12 号染色体上。
Hartz(2012) 根据成熟 MIR200A 序列(CAUCUUACCGGACAGUGCUGGA) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 MIR200A 基因对应到染色体 1p36.33。