对 Nexin 10 进行排序; SNX10
HGNC 批准的基因符号:SNX10
细胞遗传学位置:7p15.2 基因组坐标(GRCh38):7:26,291,862-26,374,383(来自 NCBI)
▼ 说明
SNX10 属于调节囊泡介导的蛋白质转移的分选连接蛋白大家族(Chen et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Teasdale 等人通过在人类数据库中搜索与酵母 SNX1(601272) 相似的序列(2001) 确定了 SNX10。推导的蛋白质具有一个中心 122 个氨基酸的 SNX 型 Phox(参见 NCF1, 608512)同源(PX) 结构域,其特征是保守的 arg-arg-tyr-X-asp/glu 和 pro-pro-X-pro-X-赖斯图案。
秦等人(2006) 报道全长 SNX10 长 201 个氨基酸,并具有 N 端 PX 结构域。过度表达后,SNX10 定位于早期内体。
陈等人(2012) 发现,在 RCC10/VHL 人肾癌细胞中,一部分表位标记的 SNX10 定位于中心粒和纤毛基部。
▼ 测绘
Hartz(2012) 根据 SNX10 序列(GenBank AF121860) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SNX10 基因对应到染色体 7p15.2。
▼ 基因功能
秦等人(2006) 发现,SNX10 的过度表达(但没有检测到任何其他 SNX)诱导了所有检测的转染细胞系中巨大液泡的形成。电子显微镜、免疫组织化学分析和布雷菲德菌素 A 处理表明,囊泡起源于早期内体,并且 SNX10 诱导的空泡化是一个高尔基依赖性过程。突变分析表明,SNX10 通过 PX 结构域中的 arg53 与 3-磷酸磷脂酰肌醇结合,但 PX 和 C 端结构域都是液泡形成所必需的。
Chen 等人在人类细胞系和斑马鱼中使用功能丧失检测(2012) 表明 SNX10 是体外和体内纤毛发生所必需的。 SNX10 与液泡 H+ ATP 酶(ATP6V1D;609398) 的 V1D 亚基结合,对于 RAB8A(165040) 阳性囊泡向睫状膜的转移至关重要。 SNX10 的 PX 结构域是与 ATP6V1D 相互作用所必需的。 SNX10 和 ATP6V1D 均定位于纤毛基部,是 RAB8A 的纤毛转移和纤毛形成所必需的。
▼ 分子遗传学
在来自 3 个不相关的近亲巴勒斯坦家庭的受影响儿童中,将常染色体隐性遗传性骨硬化症对应到染色体 7p15(OPTB8; 615085),Aker 等人(2012) 对 5 个候选基因进行了测序,并鉴定了 SNX10 基因(R51Q; 614780.0001) 中错义突变的纯合性,该突变在每个家族中与疾病分离。对 211 名种族匹配对照的筛查发现 1 名 R51Q 突变杂合携带者。在患者中破骨细胞比对照细胞更少且更小,突变体SNX10异常丰富且分布发生改变;此外,患者破骨细胞的吸收能力明显紊乱,并且内体途径受到干扰,内化右旋糖酐的分布证明了这一点。
Megarbane 等人在一名患有石骨症的 5 岁伊拉克男孩中,6 个已知的石骨症相关基因突变呈阴性(2013) 对候选基因 SNX10 进行了测序,并鉴定了无义突变的纯合性(R16X; 614780.0002)。
▼ 动物模型
陈等人(2012) 发现斑马鱼 Snx10a(而非 Snx10b)代表了人类 SNX10 的生理直系同源物。吗啡啉介导的 Snx10a 敲低导致幼虫看起来大部分正常,但心脏循环是随机的,并且吗啉体形成前肾囊肿。枯否囊泡中的纤毛数量减少,但长度没有减少。在斑马鱼中敲低 V-ATPase V1d 会导致类似的表型。用抗Snx10和抗V1d吗啉对胚胎进行联合处理,其剂量不会单独破坏心脏循环,有效地诱导了心脏循环缺陷。陈等人(2012) 得出的结论是,Snx10 和 V1d 都是斑马鱼纤毛形成和左右模式所必需的。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 骨质疏松症,常染色体隐性遗传 8
SNX10、ARG51GLN
Aker 等人在来自 3 个不相关的近亲巴勒斯坦家庭的受影响儿童中,患有常染色体隐性遗传骨硬化症,对应到染色体 7p15(OPTB8; 615085)(2012) 鉴定了 SNX10 基因外显子 3 中 152G-A 转换的纯合性,导致高度保守残基处的 arg51 至 gln(R51Q) 取代。这种突变在每个家族中随疾病而分离,在 211 个种族匹配的对照中的 1 个中发现了杂合性。患者破骨细胞表现出广泛的细胞质空泡化,而年龄匹配的对照细胞几乎不存在这种空泡化。对负载荧光右旋糖酐的细胞的检查显示,25% 的患者细胞含有大的内体液泡,而对照细胞中只有 2% 含有大的内体液泡。免疫染色显示患者细胞中突变蛋白显着增加,其分布模式与对照组显着不同,包括聚集在整个细胞质中的显着 SNX10 阳性点。功能分析表明患者的与对照细胞相比,细胞吸收的底物少得多。
.0002 骨质疏松症,常染色体隐性遗传 8
SNX10、ARG16TER
Megarbane 等人对一名患有石骨症的 5 岁伊拉克男孩(OPTB8; 615085) 进行了研究(2013) 鉴定了 SNX10 基因外显子 3 中 c.46C-T 转变的纯合性,导致 arg16 到 ter(R16X) 取代。他未受影响的父母和妹妹都是该突变的杂合子。