VAULT RNA 1-1; VTRNA1-1

HVG1
Vault RNA 成分 1； VAULTRC1

HGNC 批准的基因符号：VTRNA1-1

细胞遗传学位置：5q31.3 基因组坐标（GRCh38）：5:140,711,276-140,711,373（来自 NCBI）

▼ 说明

穹窿是大约 13 MD 的大型细胞质核糖核蛋白。它们由主要穹窿蛋白 MVP（605088）、2 个次要穹窿蛋白 TEP1（601686） 和 PARP4（607519） 以及非翻译 RNA 成分 VTRNA1-1（Kickhoefer et al., 1999） 组成。

▼ 克隆与表达

通过对人类基因组 DNA 文库进行 PCR，Kickhoefer 等人（1998） 克隆了 VTRNA1-1，他们将其称为 HVG1。 96 个碱基的 RNA 包含一个内部 RNA 聚合酶 III（参见 606007）型启动子元件，并以典型的聚合酶 III 终止信号结束。

基克霍弗等人（2003） 发现小鼠基因组仅包含 1 个表达的穹窿 RNA 基因，他们将其称为 Mvr1。 Northern印迹分析在所有检查的小鼠组织中检测到单个Mvr1转录本，其中在肺、心脏和脾脏中表达最高，在脑中表达最低。

南迪等人（2009）描述了VTRNA1-1的结构。 99 个核苷酸的 RNA 形成具有不对称内部凸起的延伸茎环结构。它包含特征性内部聚合酶 III A 框和 B 框启动子元件以及下游 B2 框基序。对分级的 HeLa 细胞进行尺寸排阻色谱分析，然后进行 Northern 和 Western 印迹分析，检测到用 MVP 洗脱的约 5% 的 VTRNA1-1 和 VTRNA1-2 含量，而 95% 保留在上清液中。

▼ 基因功能

基克霍弗等人（1998） 发现 HVG1 而不是 HVG2（VTRNA1-2; 612696） 或 HVG3（VTRNA1-3; 612696） 与人类细胞系中的穹窿相关。然而，只有一部分与穹窿相关的 HVG1 和与穹窿不相关的 HVG1 保留在可溶部分中。与亲本细胞系相比，几种耐药细胞系中 MVP 和 HVG1 的表达以及穹窿的组装增加了 15 倍。穹窿组装的增加与 HVG1 从可溶部分到颗粒部分的伴随转变有关。基克霍弗等人（1998） 假设细胞系中的绝对穹窿水平可能决定耐药性的程度。

Kickhoefer 等人使用 Northern blot 分析（1999） 发现穹窿体 RNA HVG1 和 HVG4 与来自所有人类细胞类型的穹窿体共纯化，并在酵母 3 杂交筛选中与小鼠 Tep1 相互作用。然而，Kickhoefer 等人（2003）报道HVG4不表达。

南迪等人（2009） 发现感染 Epstein-Barr 病毒（EBV） 的脐带血淋巴细胞中 VTRNA1-1、VTRNA1-2、VTRNA1-3 和 CBL3（VTRNA2-1; 614938） 的表达上调。 VTRNA1-1 的上调最高（约 1,100 倍），CBL3 的上调最低（约 3 倍）。 VTRNA1-1、VTRNA1-2 和 CBL3 的表达也被 EBV 相关的卡波西肉瘤病毒上调，但其他病毒家族的成员则没有上调。

▼ 基因结构

基克霍弗等人（2003） 确定 VTRNA1-1 基因的上游区域包含 TATA 样元件、共有近端序列和 cAMP 响应元件。

▼ 测绘

基克霍弗等人（2003） 指出 VTRNA1-1、VTRNA1-2 和 VTRNA1-3 基因对应到 5 号染色体的 16 kb 区域。vault RNA 假基因 HVG4 对应到 X 染色体。唯一表达的小鼠vault RNA 基因， Mvr1，对应到 18 号染色体。

南迪等人（2009） 指出 VTRNA1-1 基因位于 PCDHA 基因簇（604966） 附近，Wu 和 Maniatis（1999） 将其对应到染色体 5q31。