DICKKOPF WNT 信号通路抑制剂 3; DKK3
DICKKOPF,爪蟾,同源物,3
在神经胶质瘤中受到调整;RIG
HGNC 批准的基因符号:DKK3
细胞遗传学位置:11p15.3 基因组坐标(GRCh38):11:11,963,036-12,009,745(来自 NCBI)
▼ 正文
有关 WNT 和 Dickkopf 蛋白的背景信息,请参见 WNT6(604663) 和 DKK1(605189)。
▼ 克隆与表达
Ligon 等人利用胶质母细胞瘤(GBM;参见 137800)细胞和在 10 号染色体微细胞转移后抑制致瘤性的杂交细胞进行消减杂交(1997) 分离出编码 DKK3 的 cDNA,他们将其称为 RIG。 RIG 显示出一致的上调,与杂交细胞的非致瘤表型相关。 Northern印迹分析显示,2.6-kb转录物在脑中表达最高,在心脏和肺中表达较低,在胎盘、骨骼肌、胰腺和肝脏中没有表达。与正常脑组织和低级别星形细胞瘤相比,恶性GBM细胞中RIG的表达降低。预测的 11.5-kD RIG 蛋白富含精氨酸、苏氨酸和亮氨酸。
Krupnik 等人通过使用部分 DKK3 序列搜索 EST 数据库,然后探测胎儿大脑 cDNA 文库(1999)分离出编码DKK3的cDNA。推导的 350 个氨基酸的 DKK3 蛋白,与 DKK1、DKK2(605415) 和 DKK4(605417) 一样,拥有一个 N 末端信号肽和 2 个保守的富含半胱氨酸的结构域,这些结构域由接头区域分隔开,并含有 10 个半胱氨酸残基每个。第二个 cys 区域具有假定的脂质结合功能,可能促进质膜上的 WNT/DKK 相互作用。 DKK1、DKK2 和 DKK4 中的接头区包含 50 至 55 个氨基酸,而 DKK3 中仅包含 12 个氨基酸。 DKK3 具有 4 个潜在的 N-糖基化位点,并拥有第一个 cys 结构域之前的扩展 N 端结构域以及第二个 cys 结构域之后的扩展 C 端区域。所有 DKK 都有几个可能被弗林蛋白酶切割的位点。 Northern 印迹分析显示 2.5 kb DKK3 转录物广泛表达,在心脏、大脑和脊髓中表达最高。原位杂交分析表明 Dkk3 在小鼠大脑、眼睛和心脏中表达最高。 Western blot 分析表明,DKK3 作为异质 45 至 65 kD 蛋白分泌;去糖基化将蛋白质减少为 40 kD 和 45 kD 至 55 kD 的蛋白质。功能分析确定 DKK3 不会阻断非洲爪蟾 Wnt8 对青蛙胚胎次轴的诱导。
▼ 基因结构
Ligon 等人使用 Southern blot 分析(1997) 确定 DKK3 基因跨度小于 5.1 kb。它由单个外显子组成。
▼ 测绘
使用 FISH,Ligon 等人(1997) 将 DKK3 基因定位到染色体 11p15.1。